Protein–RNA interactions for Protein: Q92837

FRAT1, Proto-oncogene FRAT1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 279 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FRAT1Q92837 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
FRAT1Q92837 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
FRAT1Q92837 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
FRAT1Q92837 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
FRAT1Q92837 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
FRAT1Q92837 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
FRAT1Q92837 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
FRAT1Q92837 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
FRAT1Q92837 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
FRAT1Q92837 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
FRAT1Q92837 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
FRAT1Q92837 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
FRAT1Q92837 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
FRAT1Q92837 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
FRAT1Q92837 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
FRAT1Q92837 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
FRAT1Q92837 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
FRAT1Q92837 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
FRAT1Q92837 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
FRAT1Q92837 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
FRAT1Q92837 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
FRAT1Q92837 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
FRAT1Q92837 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
FRAT1Q92837 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
FRAT1Q92837 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
FRAT1Q92837 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
FRAT1Q92837 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
FRAT1Q92837 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
FRAT1Q92837 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
FRAT1Q92837 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
FRAT1Q92837 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
FRAT1Q92837 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
FRAT1Q92837 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
FRAT1Q92837 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
FRAT1Q92837 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
FRAT1Q92837 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
FRAT1Q92837 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
FRAT1Q92837 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
FRAT1Q92837 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
FRAT1Q92837 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
FRAT1Q92837 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
FRAT1Q92837 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
FRAT1Q92837 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
FRAT1Q92837 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
FRAT1Q92837 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
FRAT1Q92837 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
FRAT1Q92837 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
FRAT1Q92837 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
FRAT1Q92837 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
FRAT1Q92837 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
FRAT1Q92837 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
FRAT1Q92837 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
FRAT1Q92837 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
FRAT1Q92837 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
FRAT1Q92837 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
FRAT1Q92837 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
FRAT1Q92837 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
FRAT1Q92837 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
FRAT1Q92837 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
FRAT1Q92837 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
FRAT1Q92837 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
FRAT1Q92837 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
FRAT1Q92837 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
FRAT1Q92837 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
FRAT1Q92837 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
FRAT1Q92837 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC24.04■■□□□ 1.44
FRAT1Q92837 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
FRAT1Q92837 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
FRAT1Q92837 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
FRAT1Q92837 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
FRAT1Q92837 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
FRAT1Q92837 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
FRAT1Q92837 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
FRAT1Q92837 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
FRAT1Q92837 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
FRAT1Q92837 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
FRAT1Q92837 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
FRAT1Q92837 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
FRAT1Q92837 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
FRAT1Q92837 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
FRAT1Q92837 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
FRAT1Q92837 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
FRAT1Q92837 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
FRAT1Q92837 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
FRAT1Q92837 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
FRAT1Q92837 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
FRAT1Q92837 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
FRAT1Q92837 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
FRAT1Q92837 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
FRAT1Q92837 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
FRAT1Q92837 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
FRAT1Q92837 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
FRAT1Q92837 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
FRAT1Q92837 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
FRAT1Q92837 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
FRAT1Q92837 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
FRAT1Q92837 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
FRAT1Q92837 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
FRAT1Q92837 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
FRAT1Q92837 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms