Protein–RNA interactions for Protein: Q8WV48

CCDC107, Coiled-coil domain-containing protein 107, humanhuman

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC107Q8WV48 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC107Q8WV48 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC107Q8WV48 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC107Q8WV48 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC107Q8WV48 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC107Q8WV48 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC107Q8WV48 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC107Q8WV48 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC107Q8WV48 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC107Q8WV48 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC107Q8WV48 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC107Q8WV48 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC107Q8WV48 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC107Q8WV48 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC107Q8WV48 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC107Q8WV48 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC107Q8WV48 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC107Q8WV48 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC107Q8WV48 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC107Q8WV48 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC107Q8WV48 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC107Q8WV48 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC107Q8WV48 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC107Q8WV48 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC107Q8WV48 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC107Q8WV48 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC107Q8WV48 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC107Q8WV48 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC107Q8WV48 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC107Q8WV48 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC107Q8WV48 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC107Q8WV48 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC107Q8WV48 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC107Q8WV48 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC107Q8WV48 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC107Q8WV48 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC107Q8WV48 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC107Q8WV48 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC107Q8WV48 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC107Q8WV48 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC107Q8WV48 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC107Q8WV48 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC107Q8WV48 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC107Q8WV48 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC107Q8WV48 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC107Q8WV48 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC107Q8WV48 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC107Q8WV48 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC107Q8WV48 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC107Q8WV48 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC107Q8WV48 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC107Q8WV48 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC107Q8WV48 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC107Q8WV48 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC107Q8WV48 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC107Q8WV48 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC107Q8WV48 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC107Q8WV48 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC107Q8WV48 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC107Q8WV48 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC107Q8WV48 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC107Q8WV48 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC107Q8WV48 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC107Q8WV48 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC107Q8WV48 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC107Q8WV48 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC107Q8WV48 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC107Q8WV48 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC107Q8WV48 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC107Q8WV48 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC107Q8WV48 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC107Q8WV48 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC107Q8WV48 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC107Q8WV48 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC107Q8WV48 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC107Q8WV48 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC107Q8WV48 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC107Q8WV48 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC107Q8WV48 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC107Q8WV48 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC107Q8WV48 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC107Q8WV48 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC107Q8WV48 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC107Q8WV48 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC107Q8WV48 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC107Q8WV48 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC107Q8WV48 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC107Q8WV48 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC107Q8WV48 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC107Q8WV48 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC107Q8WV48 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC107Q8WV48 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC107Q8WV48 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC107Q8WV48 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC107Q8WV48 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC107Q8WV48 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC107Q8WV48 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC107Q8WV48 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC107Q8WV48 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC107Q8WV48 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms