Protein–RNA interactions for Protein: Q8TEQ0

SNX29, Sorting nexin-29, humanhuman

Predictions only

Length 813 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX29Q8TEQ0 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SNX29Q8TEQ0 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SNX29Q8TEQ0 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
SNX29Q8TEQ0 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SNX29Q8TEQ0 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SNX29Q8TEQ0 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
SNX29Q8TEQ0 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
SNX29Q8TEQ0 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
SNX29Q8TEQ0 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
SNX29Q8TEQ0 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SNX29Q8TEQ0 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
SNX29Q8TEQ0 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SNX29Q8TEQ0 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SNX29Q8TEQ0 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SNX29Q8TEQ0 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SNX29Q8TEQ0 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SNX29Q8TEQ0 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SNX29Q8TEQ0 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SNX29Q8TEQ0 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SNX29Q8TEQ0 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SNX29Q8TEQ0 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SNX29Q8TEQ0 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SNX29Q8TEQ0 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SNX29Q8TEQ0 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SNX29Q8TEQ0 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SNX29Q8TEQ0 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SNX29Q8TEQ0 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SNX29Q8TEQ0 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SNX29Q8TEQ0 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SNX29Q8TEQ0 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SNX29Q8TEQ0 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SNX29Q8TEQ0 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SNX29Q8TEQ0 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SNX29Q8TEQ0 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SNX29Q8TEQ0 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SNX29Q8TEQ0 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
SNX29Q8TEQ0 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
SNX29Q8TEQ0 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
SNX29Q8TEQ0 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC20.89■□□□□ 0.94
SNX29Q8TEQ0 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
SNX29Q8TEQ0 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
SNX29Q8TEQ0 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
SNX29Q8TEQ0 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
SNX29Q8TEQ0 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
SNX29Q8TEQ0 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
SNX29Q8TEQ0 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
SNX29Q8TEQ0 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
SNX29Q8TEQ0 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
SNX29Q8TEQ0 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
SNX29Q8TEQ0 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
SNX29Q8TEQ0 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
SNX29Q8TEQ0 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
SNX29Q8TEQ0 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
SNX29Q8TEQ0 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
SNX29Q8TEQ0 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
SNX29Q8TEQ0 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
SNX29Q8TEQ0 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
SNX29Q8TEQ0 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
SNX29Q8TEQ0 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
SNX29Q8TEQ0 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
SNX29Q8TEQ0 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
SNX29Q8TEQ0 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
SNX29Q8TEQ0 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
SNX29Q8TEQ0 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
SNX29Q8TEQ0 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
SNX29Q8TEQ0 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
SNX29Q8TEQ0 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
SNX29Q8TEQ0 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
SNX29Q8TEQ0 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
SNX29Q8TEQ0 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
SNX29Q8TEQ0 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
SNX29Q8TEQ0 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
SNX29Q8TEQ0 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SNX29Q8TEQ0 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SNX29Q8TEQ0 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SNX29Q8TEQ0 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SNX29Q8TEQ0 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SNX29Q8TEQ0 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SNX29Q8TEQ0 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SNX29Q8TEQ0 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SNX29Q8TEQ0 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SNX29Q8TEQ0 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SNX29Q8TEQ0 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SNX29Q8TEQ0 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
SNX29Q8TEQ0 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
SNX29Q8TEQ0 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
SNX29Q8TEQ0 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SNX29Q8TEQ0 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SNX29Q8TEQ0 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
SNX29Q8TEQ0 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
SNX29Q8TEQ0 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SNX29Q8TEQ0 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
SNX29Q8TEQ0 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
SNX29Q8TEQ0 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
SNX29Q8TEQ0 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
SNX29Q8TEQ0 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
SNX29Q8TEQ0 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
SNX29Q8TEQ0 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
SNX29Q8TEQ0 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
SNX29Q8TEQ0 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.9 ms