Protein–RNA interactions for Protein: Q8NHG7

SVIP, Small VCP/p97-interacting protein, humanhuman

Predictions only

Length 77 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SVIPQ8NHG7 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SVIPQ8NHG7 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SVIPQ8NHG7 ANK1-202ENST00000289734 8297 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SVIPQ8NHG7 NPTN-IT1-201ENST00000628401 2283 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
SVIPQ8NHG7 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SVIPQ8NHG7 TBC1D8B-202ENST00000310452 2589 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SVIPQ8NHG7 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SVIPQ8NHG7 MN1-201ENST00000302326 7556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SVIPQ8NHG7 FBXL19-202ENST00000380310 3796 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
SVIPQ8NHG7 ZBTB20-215ENST00000481632 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SVIPQ8NHG7 CEP170B-203ENST00000453495 6813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
SVIPQ8NHG7 PPM1F-203ENST00000407142 5587 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
SVIPQ8NHG7 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SVIPQ8NHG7 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SVIPQ8NHG7 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
SVIPQ8NHG7 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SVIPQ8NHG7 SMG8-201ENST00000300917 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SVIPQ8NHG7 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SVIPQ8NHG7 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SVIPQ8NHG7 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
SVIPQ8NHG7 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
SVIPQ8NHG7 FXYD6-207ENST00000527717 1799 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
SVIPQ8NHG7 HDAC8-207ENST00000373573 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SVIPQ8NHG7 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
SVIPQ8NHG7 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SVIPQ8NHG7 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SVIPQ8NHG7 MAST1-201ENST00000251472 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SVIPQ8NHG7 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
SVIPQ8NHG7 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
SVIPQ8NHG7 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
SVIPQ8NHG7 AFF3-202ENST00000409236 9849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
SVIPQ8NHG7 CDR2L-201ENST00000337231 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
SVIPQ8NHG7 Z97192.3-201ENST00000420902 2975 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
SVIPQ8NHG7 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
SVIPQ8NHG7 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
SVIPQ8NHG7 AC098934.1-201ENST00000443294 1835 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
SVIPQ8NHG7 MAMDC4-202ENST00000445819 3895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
SVIPQ8NHG7 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
SVIPQ8NHG7 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
SVIPQ8NHG7 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
SVIPQ8NHG7 KDM6B-201ENST00000254846 6713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
SVIPQ8NHG7 ALPP-201ENST00000392027 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
SVIPQ8NHG7 PPP1R16A-201ENST00000292539 2722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
SVIPQ8NHG7 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
SVIPQ8NHG7 CCNDBP1-201ENST00000300213 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
SVIPQ8NHG7 PDE7A-203ENST00000401827 3673 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
SVIPQ8NHG7 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
SVIPQ8NHG7 C2-206ENST00000442278 2434 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
SVIPQ8NHG7 HBP1-212ENST00000485846 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
SVIPQ8NHG7 KDM6A-214ENST00000621147 2876 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
SVIPQ8NHG7 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
SVIPQ8NHG7 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
SVIPQ8NHG7 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
SVIPQ8NHG7 GULP1-207ENST00000409843 2643 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
SVIPQ8NHG7 PID1-204ENST00000409462 2387 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
SVIPQ8NHG7 ARHGEF16-203ENST00000378378 3061 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
SVIPQ8NHG7 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
SVIPQ8NHG7 SLC26A1-201ENST00000361661 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
SVIPQ8NHG7 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
SVIPQ8NHG7 AL669831.1-201ENST00000506640 6432 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
SVIPQ8NHG7 MGAT1-205ENST00000446023 3175 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
SVIPQ8NHG7 BCAR1-207ENST00000538440 3192 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
SVIPQ8NHG7 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
SVIPQ8NHG7 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
SVIPQ8NHG7 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
SVIPQ8NHG7 ADORA1-201ENST00000309502 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
SVIPQ8NHG7 FOXN3-219ENST00000615335 2421 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
SVIPQ8NHG7 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
SVIPQ8NHG7 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
SVIPQ8NHG7 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
SVIPQ8NHG7 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
SVIPQ8NHG7 RER1-203ENST00000378513 3000 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
SVIPQ8NHG7 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
SVIPQ8NHG7 AMMECR1-IT1-201ENST00000418848 561 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
SVIPQ8NHG7 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
SVIPQ8NHG7 AC021683.3-202ENST00000592572 4440 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
SVIPQ8NHG7 CDH23-201ENST00000224721 11139 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
SVIPQ8NHG7 CDH23-214ENST00000622827 11122 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
SVIPQ8NHG7 VIPAS39-206ENST00000553888 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
SVIPQ8NHG7 CCNA1-201ENST00000255465 1879 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
SVIPQ8NHG7 SYCP2L-201ENST00000283141 3130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
SVIPQ8NHG7 RNF34-203ENST00000392465 2051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
SVIPQ8NHG7 OSBPL10-201ENST00000396556 6600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
SVIPQ8NHG7 SPOCD1-201ENST00000257100 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
SVIPQ8NHG7 DAXX-213ENST00000620164 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
SVIPQ8NHG7 DOK4-210ENST00000566936 2851 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
SVIPQ8NHG7 FBN3-205ENST00000600128 9362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
SVIPQ8NHG7 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
SVIPQ8NHG7 NAP1L6-201ENST00000373518 2044 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
SVIPQ8NHG7 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
SVIPQ8NHG7 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
SVIPQ8NHG7 SLC25A25-204ENST00000373069 3376 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
SVIPQ8NHG7 MAP2K7-203ENST00000397983 3396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
SVIPQ8NHG7 HNRNPUL1-201ENST00000263367 2952 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
SVIPQ8NHG7 ADGRE2-209ENST00000596991 2596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
SVIPQ8NHG7 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
SVIPQ8NHG7 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
SVIPQ8NHG7 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
SVIPQ8NHG7 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
SVIPQ8NHG7 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms