Protein–RNA interactions for Protein: Q8NDP4

ZNF439, Zinc finger protein 439, humanhuman

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Length 499 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF439Q8NDP4 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF439Q8NDP4 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF439Q8NDP4 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF439Q8NDP4 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF439Q8NDP4 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF439Q8NDP4 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF439Q8NDP4 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF439Q8NDP4 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF439Q8NDP4 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF439Q8NDP4 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF439Q8NDP4 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF439Q8NDP4 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF439Q8NDP4 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF439Q8NDP4 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF439Q8NDP4 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF439Q8NDP4 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF439Q8NDP4 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF439Q8NDP4 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF439Q8NDP4 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF439Q8NDP4 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF439Q8NDP4 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF439Q8NDP4 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF439Q8NDP4 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF439Q8NDP4 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF439Q8NDP4 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
ZNF439Q8NDP4 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZNF439Q8NDP4 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZNF439Q8NDP4 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZNF439Q8NDP4 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZNF439Q8NDP4 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZNF439Q8NDP4 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZNF439Q8NDP4 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZNF439Q8NDP4 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZNF439Q8NDP4 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZNF439Q8NDP4 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZNF439Q8NDP4 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZNF439Q8NDP4 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZNF439Q8NDP4 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZNF439Q8NDP4 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZNF439Q8NDP4 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZNF439Q8NDP4 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
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ZNF439Q8NDP4 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
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ZNF439Q8NDP4 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZNF439Q8NDP4 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZNF439Q8NDP4 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZNF439Q8NDP4 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZNF439Q8NDP4 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZNF439Q8NDP4 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
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ZNF439Q8NDP4 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
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ZNF439Q8NDP4 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
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ZNF439Q8NDP4 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZNF439Q8NDP4 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZNF439Q8NDP4 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZNF439Q8NDP4 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZNF439Q8NDP4 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
ZNF439Q8NDP4 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZNF439Q8NDP4 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZNF439Q8NDP4 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZNF439Q8NDP4 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZNF439Q8NDP4 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZNF439Q8NDP4 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZNF439Q8NDP4 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZNF439Q8NDP4 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZNF439Q8NDP4 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZNF439Q8NDP4 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZNF439Q8NDP4 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZNF439Q8NDP4 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZNF439Q8NDP4 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZNF439Q8NDP4 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZNF439Q8NDP4 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZNF439Q8NDP4 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZNF439Q8NDP4 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZNF439Q8NDP4 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZNF439Q8NDP4 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZNF439Q8NDP4 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
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