Protein–RNA interactions for Protein: Q8ND23

CARMIL3, Capping protein, Arp2/3 and myosin-I linker protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CARMIL3Q8ND23 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
CARMIL3Q8ND23 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
CARMIL3Q8ND23 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CARMIL3Q8ND23 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CARMIL3Q8ND23 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CARMIL3Q8ND23 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
CARMIL3Q8ND23 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CARMIL3Q8ND23 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
CARMIL3Q8ND23 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CARMIL3Q8ND23 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CARMIL3Q8ND23 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CARMIL3Q8ND23 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CARMIL3Q8ND23 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CARMIL3Q8ND23 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CARMIL3Q8ND23 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CARMIL3Q8ND23 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
CARMIL3Q8ND23 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CARMIL3Q8ND23 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CARMIL3Q8ND23 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CARMIL3Q8ND23 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CARMIL3Q8ND23 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CARMIL3Q8ND23 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CARMIL3Q8ND23 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CARMIL3Q8ND23 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CARMIL3Q8ND23 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CARMIL3Q8ND23 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CARMIL3Q8ND23 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CARMIL3Q8ND23 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
CARMIL3Q8ND23 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
CARMIL3Q8ND23 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CARMIL3Q8ND23 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CARMIL3Q8ND23 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CARMIL3Q8ND23 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CARMIL3Q8ND23 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CARMIL3Q8ND23 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CARMIL3Q8ND23 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
CARMIL3Q8ND23 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
CARMIL3Q8ND23 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CARMIL3Q8ND23 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CARMIL3Q8ND23 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CARMIL3Q8ND23 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CARMIL3Q8ND23 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CARMIL3Q8ND23 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CARMIL3Q8ND23 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CARMIL3Q8ND23 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CARMIL3Q8ND23 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CARMIL3Q8ND23 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CARMIL3Q8ND23 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CARMIL3Q8ND23 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CARMIL3Q8ND23 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CARMIL3Q8ND23 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CARMIL3Q8ND23 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CARMIL3Q8ND23 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CARMIL3Q8ND23 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CARMIL3Q8ND23 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
CARMIL3Q8ND23 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CARMIL3Q8ND23 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
CARMIL3Q8ND23 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CARMIL3Q8ND23 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
CARMIL3Q8ND23 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
CARMIL3Q8ND23 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CARMIL3Q8ND23 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
CARMIL3Q8ND23 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CARMIL3Q8ND23 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CARMIL3Q8ND23 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CARMIL3Q8ND23 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CARMIL3Q8ND23 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CARMIL3Q8ND23 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CARMIL3Q8ND23 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CARMIL3Q8ND23 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CARMIL3Q8ND23 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CARMIL3Q8ND23 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CARMIL3Q8ND23 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
CARMIL3Q8ND23 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CARMIL3Q8ND23 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CARMIL3Q8ND23 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CARMIL3Q8ND23 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CARMIL3Q8ND23 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CARMIL3Q8ND23 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CARMIL3Q8ND23 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CARMIL3Q8ND23 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CARMIL3Q8ND23 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CARMIL3Q8ND23 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
CARMIL3Q8ND23 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CARMIL3Q8ND23 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CARMIL3Q8ND23 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CARMIL3Q8ND23 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
CARMIL3Q8ND23 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CARMIL3Q8ND23 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CARMIL3Q8ND23 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CARMIL3Q8ND23 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CARMIL3Q8ND23 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CARMIL3Q8ND23 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CARMIL3Q8ND23 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CARMIL3Q8ND23 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
CARMIL3Q8ND23 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CARMIL3Q8ND23 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CARMIL3Q8ND23 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CARMIL3Q8ND23 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CARMIL3Q8ND23 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms