Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCD3

HJURP, Holliday junction recognition protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 748 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HJURPQ8NCD3 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
HJURPQ8NCD3 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
HJURPQ8NCD3 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
HJURPQ8NCD3 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
HJURPQ8NCD3 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
HJURPQ8NCD3 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
HJURPQ8NCD3 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
HJURPQ8NCD3 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
HJURPQ8NCD3 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
HJURPQ8NCD3 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
HJURPQ8NCD3 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
HJURPQ8NCD3 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
HJURPQ8NCD3 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
HJURPQ8NCD3 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
HJURPQ8NCD3 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
HJURPQ8NCD3 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
HJURPQ8NCD3 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
HJURPQ8NCD3 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
HJURPQ8NCD3 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
HJURPQ8NCD3 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
HJURPQ8NCD3 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
HJURPQ8NCD3 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
HJURPQ8NCD3 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
HJURPQ8NCD3 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
HJURPQ8NCD3 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
HJURPQ8NCD3 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
HJURPQ8NCD3 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
HJURPQ8NCD3 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
HJURPQ8NCD3 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
HJURPQ8NCD3 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
HJURPQ8NCD3 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
HJURPQ8NCD3 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
HJURPQ8NCD3 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
HJURPQ8NCD3 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
HJURPQ8NCD3 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
HJURPQ8NCD3 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
HJURPQ8NCD3 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
HJURPQ8NCD3 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
HJURPQ8NCD3 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
HJURPQ8NCD3 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
HJURPQ8NCD3 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
HJURPQ8NCD3 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
HJURPQ8NCD3 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
HJURPQ8NCD3 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
HJURPQ8NCD3 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
HJURPQ8NCD3 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
HJURPQ8NCD3 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
HJURPQ8NCD3 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
HJURPQ8NCD3 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
HJURPQ8NCD3 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
HJURPQ8NCD3 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
HJURPQ8NCD3 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
HJURPQ8NCD3 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
HJURPQ8NCD3 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
HJURPQ8NCD3 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
HJURPQ8NCD3 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
HJURPQ8NCD3 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
HJURPQ8NCD3 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
HJURPQ8NCD3 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
HJURPQ8NCD3 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
HJURPQ8NCD3 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
HJURPQ8NCD3 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
HJURPQ8NCD3 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
HJURPQ8NCD3 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
HJURPQ8NCD3 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
HJURPQ8NCD3 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
HJURPQ8NCD3 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
HJURPQ8NCD3 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
HJURPQ8NCD3 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
HJURPQ8NCD3 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
HJURPQ8NCD3 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
HJURPQ8NCD3 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
HJURPQ8NCD3 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
HJURPQ8NCD3 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
HJURPQ8NCD3 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
HJURPQ8NCD3 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
HJURPQ8NCD3 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
HJURPQ8NCD3 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
HJURPQ8NCD3 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
HJURPQ8NCD3 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
HJURPQ8NCD3 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
HJURPQ8NCD3 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
HJURPQ8NCD3 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
HJURPQ8NCD3 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
HJURPQ8NCD3 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
HJURPQ8NCD3 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
HJURPQ8NCD3 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
HJURPQ8NCD3 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
HJURPQ8NCD3 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
HJURPQ8NCD3 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
HJURPQ8NCD3 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
HJURPQ8NCD3 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
HJURPQ8NCD3 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
HJURPQ8NCD3 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
HJURPQ8NCD3 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
HJURPQ8NCD3 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
HJURPQ8NCD3 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
HJURPQ8NCD3 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
HJURPQ8NCD3 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
HJURPQ8NCD3 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms