Protein–RNA interactions for Protein: Q8NA03

FSIP1, Fibrous sheath-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 581 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FSIP1Q8NA03 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
FSIP1Q8NA03 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
FSIP1Q8NA03 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
FSIP1Q8NA03 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
FSIP1Q8NA03 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
FSIP1Q8NA03 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
FSIP1Q8NA03 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
FSIP1Q8NA03 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
FSIP1Q8NA03 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
FSIP1Q8NA03 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
FSIP1Q8NA03 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
FSIP1Q8NA03 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC21.26■□□□□ 0.99
FSIP1Q8NA03 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
FSIP1Q8NA03 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
FSIP1Q8NA03 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
FSIP1Q8NA03 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
FSIP1Q8NA03 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
FSIP1Q8NA03 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
FSIP1Q8NA03 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
FSIP1Q8NA03 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
FSIP1Q8NA03 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
FSIP1Q8NA03 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
FSIP1Q8NA03 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
FSIP1Q8NA03 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC21.25■□□□□ 0.99
FSIP1Q8NA03 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
FSIP1Q8NA03 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
FSIP1Q8NA03 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
FSIP1Q8NA03 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
FSIP1Q8NA03 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
FSIP1Q8NA03 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
FSIP1Q8NA03 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
FSIP1Q8NA03 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
FSIP1Q8NA03 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
FSIP1Q8NA03 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
FSIP1Q8NA03 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
FSIP1Q8NA03 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
FSIP1Q8NA03 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
FSIP1Q8NA03 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
FSIP1Q8NA03 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
FSIP1Q8NA03 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
FSIP1Q8NA03 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
FSIP1Q8NA03 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
FSIP1Q8NA03 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
FSIP1Q8NA03 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
FSIP1Q8NA03 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
FSIP1Q8NA03 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
FSIP1Q8NA03 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
FSIP1Q8NA03 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
FSIP1Q8NA03 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
FSIP1Q8NA03 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
FSIP1Q8NA03 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
FSIP1Q8NA03 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
FSIP1Q8NA03 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
FSIP1Q8NA03 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
FSIP1Q8NA03 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
FSIP1Q8NA03 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
FSIP1Q8NA03 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
FSIP1Q8NA03 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
FSIP1Q8NA03 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
FSIP1Q8NA03 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
FSIP1Q8NA03 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
FSIP1Q8NA03 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
FSIP1Q8NA03 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
FSIP1Q8NA03 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
FSIP1Q8NA03 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
FSIP1Q8NA03 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
FSIP1Q8NA03 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
FSIP1Q8NA03 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
FSIP1Q8NA03 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
FSIP1Q8NA03 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
FSIP1Q8NA03 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
FSIP1Q8NA03 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
FSIP1Q8NA03 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
FSIP1Q8NA03 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
FSIP1Q8NA03 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
FSIP1Q8NA03 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
FSIP1Q8NA03 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
FSIP1Q8NA03 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
FSIP1Q8NA03 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
FSIP1Q8NA03 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
FSIP1Q8NA03 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
FSIP1Q8NA03 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
FSIP1Q8NA03 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
FSIP1Q8NA03 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
FSIP1Q8NA03 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
FSIP1Q8NA03 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
FSIP1Q8NA03 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
FSIP1Q8NA03 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
FSIP1Q8NA03 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
FSIP1Q8NA03 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
FSIP1Q8NA03 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
FSIP1Q8NA03 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
FSIP1Q8NA03 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
FSIP1Q8NA03 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
FSIP1Q8NA03 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
FSIP1Q8NA03 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
FSIP1Q8NA03 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
FSIP1Q8NA03 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
FSIP1Q8NA03 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
FSIP1Q8NA03 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.1 ms