Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9V6

ANKRD53, Ankyrin repeat domain-containing protein 53, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD53Q8N9V6 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ANKRD53Q8N9V6 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ANKRD53Q8N9V6 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ANKRD53Q8N9V6 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ANKRD53Q8N9V6 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ANKRD53Q8N9V6 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ANKRD53Q8N9V6 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ANKRD53Q8N9V6 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ANKRD53Q8N9V6 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ANKRD53Q8N9V6 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ANKRD53Q8N9V6 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ANKRD53Q8N9V6 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ANKRD53Q8N9V6 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ANKRD53Q8N9V6 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ANKRD53Q8N9V6 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ANKRD53Q8N9V6 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ANKRD53Q8N9V6 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ANKRD53Q8N9V6 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ANKRD53Q8N9V6 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ANKRD53Q8N9V6 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ANKRD53Q8N9V6 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ANKRD53Q8N9V6 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ANKRD53Q8N9V6 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
ANKRD53Q8N9V6 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ANKRD53Q8N9V6 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ANKRD53Q8N9V6 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ANKRD53Q8N9V6 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ANKRD53Q8N9V6 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ANKRD53Q8N9V6 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ANKRD53Q8N9V6 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ANKRD53Q8N9V6 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ANKRD53Q8N9V6 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ANKRD53Q8N9V6 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ANKRD53Q8N9V6 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ANKRD53Q8N9V6 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ANKRD53Q8N9V6 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ANKRD53Q8N9V6 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ANKRD53Q8N9V6 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ANKRD53Q8N9V6 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ANKRD53Q8N9V6 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ANKRD53Q8N9V6 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ANKRD53Q8N9V6 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ANKRD53Q8N9V6 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ANKRD53Q8N9V6 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ANKRD53Q8N9V6 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ANKRD53Q8N9V6 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ANKRD53Q8N9V6 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ANKRD53Q8N9V6 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ANKRD53Q8N9V6 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ANKRD53Q8N9V6 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ANKRD53Q8N9V6 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ANKRD53Q8N9V6 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ANKRD53Q8N9V6 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
ANKRD53Q8N9V6 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ANKRD53Q8N9V6 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ANKRD53Q8N9V6 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ANKRD53Q8N9V6 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ANKRD53Q8N9V6 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ANKRD53Q8N9V6 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ANKRD53Q8N9V6 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ANKRD53Q8N9V6 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ANKRD53Q8N9V6 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ANKRD53Q8N9V6 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ANKRD53Q8N9V6 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ANKRD53Q8N9V6 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ANKRD53Q8N9V6 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ANKRD53Q8N9V6 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ANKRD53Q8N9V6 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ANKRD53Q8N9V6 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ANKRD53Q8N9V6 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ANKRD53Q8N9V6 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ANKRD53Q8N9V6 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ANKRD53Q8N9V6 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ANKRD53Q8N9V6 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ANKRD53Q8N9V6 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ANKRD53Q8N9V6 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ANKRD53Q8N9V6 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ANKRD53Q8N9V6 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ANKRD53Q8N9V6 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ANKRD53Q8N9V6 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
ANKRD53Q8N9V6 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
ANKRD53Q8N9V6 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ANKRD53Q8N9V6 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ANKRD53Q8N9V6 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ANKRD53Q8N9V6 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ANKRD53Q8N9V6 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ANKRD53Q8N9V6 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ANKRD53Q8N9V6 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ANKRD53Q8N9V6 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ANKRD53Q8N9V6 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ANKRD53Q8N9V6 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ANKRD53Q8N9V6 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ANKRD53Q8N9V6 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ANKRD53Q8N9V6 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ANKRD53Q8N9V6 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ANKRD53Q8N9V6 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ANKRD53Q8N9V6 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ANKRD53Q8N9V6 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
ANKRD53Q8N9V6 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ANKRD53Q8N9V6 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms