Protein–RNA interactions for Protein: Q8N4Y2

CRACR2B, EF-hand calcium-binding domain-containing protein 4A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 399 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRACR2BQ8N4Y2 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CRACR2BQ8N4Y2 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CRACR2BQ8N4Y2 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CRACR2BQ8N4Y2 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CRACR2BQ8N4Y2 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CRACR2BQ8N4Y2 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CRACR2BQ8N4Y2 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CRACR2BQ8N4Y2 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CRACR2BQ8N4Y2 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CRACR2BQ8N4Y2 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CRACR2BQ8N4Y2 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CRACR2BQ8N4Y2 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CRACR2BQ8N4Y2 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CRACR2BQ8N4Y2 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CRACR2BQ8N4Y2 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CRACR2BQ8N4Y2 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CRACR2BQ8N4Y2 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CRACR2BQ8N4Y2 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CRACR2BQ8N4Y2 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CRACR2BQ8N4Y2 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CRACR2BQ8N4Y2 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CRACR2BQ8N4Y2 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
CRACR2BQ8N4Y2 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CRACR2BQ8N4Y2 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CRACR2BQ8N4Y2 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CRACR2BQ8N4Y2 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CRACR2BQ8N4Y2 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CRACR2BQ8N4Y2 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CRACR2BQ8N4Y2 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CRACR2BQ8N4Y2 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CRACR2BQ8N4Y2 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CRACR2BQ8N4Y2 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CRACR2BQ8N4Y2 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CRACR2BQ8N4Y2 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CRACR2BQ8N4Y2 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CRACR2BQ8N4Y2 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CRACR2BQ8N4Y2 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CRACR2BQ8N4Y2 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CRACR2BQ8N4Y2 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CRACR2BQ8N4Y2 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CRACR2BQ8N4Y2 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CRACR2BQ8N4Y2 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CRACR2BQ8N4Y2 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CRACR2BQ8N4Y2 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CRACR2BQ8N4Y2 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
CRACR2BQ8N4Y2 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CRACR2BQ8N4Y2 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
CRACR2BQ8N4Y2 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CRACR2BQ8N4Y2 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CRACR2BQ8N4Y2 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
CRACR2BQ8N4Y2 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CRACR2BQ8N4Y2 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CRACR2BQ8N4Y2 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CRACR2BQ8N4Y2 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CRACR2BQ8N4Y2 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CRACR2BQ8N4Y2 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CRACR2BQ8N4Y2 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CRACR2BQ8N4Y2 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CRACR2BQ8N4Y2 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CRACR2BQ8N4Y2 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CRACR2BQ8N4Y2 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CRACR2BQ8N4Y2 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CRACR2BQ8N4Y2 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CRACR2BQ8N4Y2 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CRACR2BQ8N4Y2 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CRACR2BQ8N4Y2 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CRACR2BQ8N4Y2 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CRACR2BQ8N4Y2 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CRACR2BQ8N4Y2 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CRACR2BQ8N4Y2 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CRACR2BQ8N4Y2 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CRACR2BQ8N4Y2 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CRACR2BQ8N4Y2 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CRACR2BQ8N4Y2 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CRACR2BQ8N4Y2 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CRACR2BQ8N4Y2 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CRACR2BQ8N4Y2 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CRACR2BQ8N4Y2 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CRACR2BQ8N4Y2 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CRACR2BQ8N4Y2 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CRACR2BQ8N4Y2 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CRACR2BQ8N4Y2 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CRACR2BQ8N4Y2 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CRACR2BQ8N4Y2 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CRACR2BQ8N4Y2 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CRACR2BQ8N4Y2 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CRACR2BQ8N4Y2 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
CRACR2BQ8N4Y2 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CRACR2BQ8N4Y2 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CRACR2BQ8N4Y2 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CRACR2BQ8N4Y2 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CRACR2BQ8N4Y2 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CRACR2BQ8N4Y2 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CRACR2BQ8N4Y2 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CRACR2BQ8N4Y2 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CRACR2BQ8N4Y2 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CRACR2BQ8N4Y2 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CRACR2BQ8N4Y2 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CRACR2BQ8N4Y2 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CRACR2BQ8N4Y2 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms