Protein–RNA interactions for Protein: Q8IVL6

P3H3, Prolyl 3-hydroxylase 3, humanhuman

Predictions only

Length 736 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P3H3Q8IVL6 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
P3H3Q8IVL6 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
P3H3Q8IVL6 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
P3H3Q8IVL6 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.54■■■□□ 2.32
P3H3Q8IVL6 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC29.54■■■□□ 2.32
P3H3Q8IVL6 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC29.54■■■□□ 2.32
P3H3Q8IVL6 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC29.54■■■□□ 2.32
P3H3Q8IVL6 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
P3H3Q8IVL6 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
P3H3Q8IVL6 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
P3H3Q8IVL6 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
P3H3Q8IVL6 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
P3H3Q8IVL6 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
P3H3Q8IVL6 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
P3H3Q8IVL6 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
P3H3Q8IVL6 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
P3H3Q8IVL6 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
P3H3Q8IVL6 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
P3H3Q8IVL6 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
P3H3Q8IVL6 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
P3H3Q8IVL6 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
P3H3Q8IVL6 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
P3H3Q8IVL6 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
P3H3Q8IVL6 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
P3H3Q8IVL6 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
P3H3Q8IVL6 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
P3H3Q8IVL6 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC29.53■■■□□ 2.32
P3H3Q8IVL6 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
P3H3Q8IVL6 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
P3H3Q8IVL6 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC29.53■■■□□ 2.32
P3H3Q8IVL6 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
P3H3Q8IVL6 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC29.52■■■□□ 2.32
P3H3Q8IVL6 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
P3H3Q8IVL6 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
P3H3Q8IVL6 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
P3H3Q8IVL6 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
P3H3Q8IVL6 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
P3H3Q8IVL6 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
P3H3Q8IVL6 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
P3H3Q8IVL6 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.52■■■□□ 2.32
P3H3Q8IVL6 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
P3H3Q8IVL6 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC29.52■■■□□ 2.32
P3H3Q8IVL6 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
P3H3Q8IVL6 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
P3H3Q8IVL6 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
P3H3Q8IVL6 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
P3H3Q8IVL6 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.32
P3H3Q8IVL6 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.32
P3H3Q8IVL6 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
P3H3Q8IVL6 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
P3H3Q8IVL6 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
P3H3Q8IVL6 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
P3H3Q8IVL6 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC29.51■■■□□ 2.31
P3H3Q8IVL6 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC29.51■■■□□ 2.31
P3H3Q8IVL6 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
P3H3Q8IVL6 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
P3H3Q8IVL6 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
P3H3Q8IVL6 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC29.51■■■□□ 2.31
P3H3Q8IVL6 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
P3H3Q8IVL6 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
P3H3Q8IVL6 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
P3H3Q8IVL6 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
P3H3Q8IVL6 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
P3H3Q8IVL6 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
P3H3Q8IVL6 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC29.5■■■□□ 2.31
P3H3Q8IVL6 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
P3H3Q8IVL6 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
P3H3Q8IVL6 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
P3H3Q8IVL6 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
P3H3Q8IVL6 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
P3H3Q8IVL6 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
P3H3Q8IVL6 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
P3H3Q8IVL6 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
P3H3Q8IVL6 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
P3H3Q8IVL6 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
P3H3Q8IVL6 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
P3H3Q8IVL6 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.5■■■□□ 2.31
P3H3Q8IVL6 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
P3H3Q8IVL6 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
P3H3Q8IVL6 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
P3H3Q8IVL6 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC29.5■■■□□ 2.31
P3H3Q8IVL6 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
P3H3Q8IVL6 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
P3H3Q8IVL6 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
P3H3Q8IVL6 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
P3H3Q8IVL6 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
P3H3Q8IVL6 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
P3H3Q8IVL6 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
P3H3Q8IVL6 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
P3H3Q8IVL6 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
P3H3Q8IVL6 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
P3H3Q8IVL6 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
P3H3Q8IVL6 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
P3H3Q8IVL6 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
P3H3Q8IVL6 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
P3H3Q8IVL6 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC29.49■■■□□ 2.31
P3H3Q8IVL6 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
P3H3Q8IVL6 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
P3H3Q8IVL6 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
P3H3Q8IVL6 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC29.49■■■□□ 2.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms