Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3V4

UBE3B, Ubiquitin-protein ligase E3B, humanhuman

Predictions only

Length 1,068 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE3BQ7Z3V4 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
UBE3BQ7Z3V4 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC23.24■■□□□ 1.31
UBE3BQ7Z3V4 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
UBE3BQ7Z3V4 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
UBE3BQ7Z3V4 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
UBE3BQ7Z3V4 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
UBE3BQ7Z3V4 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
UBE3BQ7Z3V4 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
UBE3BQ7Z3V4 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
UBE3BQ7Z3V4 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
UBE3BQ7Z3V4 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
UBE3BQ7Z3V4 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC23.23■■□□□ 1.31
UBE3BQ7Z3V4 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
UBE3BQ7Z3V4 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
UBE3BQ7Z3V4 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
UBE3BQ7Z3V4 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
UBE3BQ7Z3V4 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
UBE3BQ7Z3V4 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
UBE3BQ7Z3V4 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
UBE3BQ7Z3V4 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
UBE3BQ7Z3V4 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
UBE3BQ7Z3V4 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
UBE3BQ7Z3V4 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
UBE3BQ7Z3V4 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
UBE3BQ7Z3V4 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
UBE3BQ7Z3V4 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
UBE3BQ7Z3V4 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
UBE3BQ7Z3V4 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
UBE3BQ7Z3V4 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
UBE3BQ7Z3V4 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
UBE3BQ7Z3V4 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
UBE3BQ7Z3V4 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
UBE3BQ7Z3V4 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
UBE3BQ7Z3V4 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
UBE3BQ7Z3V4 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
UBE3BQ7Z3V4 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
UBE3BQ7Z3V4 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
UBE3BQ7Z3V4 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
UBE3BQ7Z3V4 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
UBE3BQ7Z3V4 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
UBE3BQ7Z3V4 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
UBE3BQ7Z3V4 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
UBE3BQ7Z3V4 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
UBE3BQ7Z3V4 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
UBE3BQ7Z3V4 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
UBE3BQ7Z3V4 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
UBE3BQ7Z3V4 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
UBE3BQ7Z3V4 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
UBE3BQ7Z3V4 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
UBE3BQ7Z3V4 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
UBE3BQ7Z3V4 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
UBE3BQ7Z3V4 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
UBE3BQ7Z3V4 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
UBE3BQ7Z3V4 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
UBE3BQ7Z3V4 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
UBE3BQ7Z3V4 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
UBE3BQ7Z3V4 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
UBE3BQ7Z3V4 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
UBE3BQ7Z3V4 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
UBE3BQ7Z3V4 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
UBE3BQ7Z3V4 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
UBE3BQ7Z3V4 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
UBE3BQ7Z3V4 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
UBE3BQ7Z3V4 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
UBE3BQ7Z3V4 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
UBE3BQ7Z3V4 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
UBE3BQ7Z3V4 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
UBE3BQ7Z3V4 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
UBE3BQ7Z3V4 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
UBE3BQ7Z3V4 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
UBE3BQ7Z3V4 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
UBE3BQ7Z3V4 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
UBE3BQ7Z3V4 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
UBE3BQ7Z3V4 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
UBE3BQ7Z3V4 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
UBE3BQ7Z3V4 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
UBE3BQ7Z3V4 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
UBE3BQ7Z3V4 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
UBE3BQ7Z3V4 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
UBE3BQ7Z3V4 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
UBE3BQ7Z3V4 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
UBE3BQ7Z3V4 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
UBE3BQ7Z3V4 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
UBE3BQ7Z3V4 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
UBE3BQ7Z3V4 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
UBE3BQ7Z3V4 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
UBE3BQ7Z3V4 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
UBE3BQ7Z3V4 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
UBE3BQ7Z3V4 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
UBE3BQ7Z3V4 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
UBE3BQ7Z3V4 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
UBE3BQ7Z3V4 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
UBE3BQ7Z3V4 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
UBE3BQ7Z3V4 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
UBE3BQ7Z3V4 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
UBE3BQ7Z3V4 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
UBE3BQ7Z3V4 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
UBE3BQ7Z3V4 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
UBE3BQ7Z3V4 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
UBE3BQ7Z3V4 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms