Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTU1

TCF23, Transcription factor 23, humanhuman

Predictions only

Length 214 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCF23Q7RTU1 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TCF23Q7RTU1 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TCF23Q7RTU1 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TCF23Q7RTU1 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TCF23Q7RTU1 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TCF23Q7RTU1 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TCF23Q7RTU1 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
TCF23Q7RTU1 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
TCF23Q7RTU1 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TCF23Q7RTU1 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
TCF23Q7RTU1 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TCF23Q7RTU1 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TCF23Q7RTU1 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TCF23Q7RTU1 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
TCF23Q7RTU1 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TCF23Q7RTU1 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TCF23Q7RTU1 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TCF23Q7RTU1 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TCF23Q7RTU1 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TCF23Q7RTU1 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TCF23Q7RTU1 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TCF23Q7RTU1 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TCF23Q7RTU1 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TCF23Q7RTU1 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TCF23Q7RTU1 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TCF23Q7RTU1 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TCF23Q7RTU1 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
TCF23Q7RTU1 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TCF23Q7RTU1 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TCF23Q7RTU1 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TCF23Q7RTU1 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TCF23Q7RTU1 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TCF23Q7RTU1 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TCF23Q7RTU1 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TCF23Q7RTU1 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
TCF23Q7RTU1 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TCF23Q7RTU1 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TCF23Q7RTU1 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TCF23Q7RTU1 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TCF23Q7RTU1 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TCF23Q7RTU1 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TCF23Q7RTU1 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TCF23Q7RTU1 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TCF23Q7RTU1 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TCF23Q7RTU1 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TCF23Q7RTU1 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TCF23Q7RTU1 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TCF23Q7RTU1 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TCF23Q7RTU1 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TCF23Q7RTU1 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TCF23Q7RTU1 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TCF23Q7RTU1 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TCF23Q7RTU1 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TCF23Q7RTU1 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TCF23Q7RTU1 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TCF23Q7RTU1 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
TCF23Q7RTU1 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TCF23Q7RTU1 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TCF23Q7RTU1 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TCF23Q7RTU1 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TCF23Q7RTU1 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TCF23Q7RTU1 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TCF23Q7RTU1 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TCF23Q7RTU1 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TCF23Q7RTU1 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TCF23Q7RTU1 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TCF23Q7RTU1 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TCF23Q7RTU1 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TCF23Q7RTU1 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
TCF23Q7RTU1 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
TCF23Q7RTU1 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TCF23Q7RTU1 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TCF23Q7RTU1 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TCF23Q7RTU1 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TCF23Q7RTU1 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TCF23Q7RTU1 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
TCF23Q7RTU1 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TCF23Q7RTU1 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TCF23Q7RTU1 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TCF23Q7RTU1 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TCF23Q7RTU1 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TCF23Q7RTU1 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TCF23Q7RTU1 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TCF23Q7RTU1 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TCF23Q7RTU1 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TCF23Q7RTU1 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TCF23Q7RTU1 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TCF23Q7RTU1 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TCF23Q7RTU1 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TCF23Q7RTU1 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TCF23Q7RTU1 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TCF23Q7RTU1 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TCF23Q7RTU1 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TCF23Q7RTU1 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TCF23Q7RTU1 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TCF23Q7RTU1 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TCF23Q7RTU1 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TCF23Q7RTU1 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TCF23Q7RTU1 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TCF23Q7RTU1 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms