Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZP82

CCDC141, Coiled-coil domain-containing protein 141, humanhuman

Predictions only

Length 1,450 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC141Q6ZP82 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CCDC141Q6ZP82 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CCDC141Q6ZP82 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
CCDC141Q6ZP82 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CCDC141Q6ZP82 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CCDC141Q6ZP82 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
CCDC141Q6ZP82 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CCDC141Q6ZP82 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CCDC141Q6ZP82 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CCDC141Q6ZP82 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CCDC141Q6ZP82 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CCDC141Q6ZP82 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
CCDC141Q6ZP82 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CCDC141Q6ZP82 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
CCDC141Q6ZP82 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
CCDC141Q6ZP82 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
CCDC141Q6ZP82 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
CCDC141Q6ZP82 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CCDC141Q6ZP82 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CCDC141Q6ZP82 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
CCDC141Q6ZP82 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CCDC141Q6ZP82 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CCDC141Q6ZP82 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
CCDC141Q6ZP82 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CCDC141Q6ZP82 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CCDC141Q6ZP82 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CCDC141Q6ZP82 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CCDC141Q6ZP82 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
CCDC141Q6ZP82 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
CCDC141Q6ZP82 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CCDC141Q6ZP82 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CCDC141Q6ZP82 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CCDC141Q6ZP82 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
CCDC141Q6ZP82 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CCDC141Q6ZP82 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
CCDC141Q6ZP82 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
CCDC141Q6ZP82 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
CCDC141Q6ZP82 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.04
CCDC141Q6ZP82 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
CCDC141Q6ZP82 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.04
CCDC141Q6ZP82 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
CCDC141Q6ZP82 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
CCDC141Q6ZP82 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
CCDC141Q6ZP82 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
CCDC141Q6ZP82 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
CCDC141Q6ZP82 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
CCDC141Q6ZP82 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
CCDC141Q6ZP82 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
CCDC141Q6ZP82 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
CCDC141Q6ZP82 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
CCDC141Q6ZP82 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
CCDC141Q6ZP82 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
CCDC141Q6ZP82 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
CCDC141Q6ZP82 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
CCDC141Q6ZP82 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
CCDC141Q6ZP82 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
CCDC141Q6ZP82 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
CCDC141Q6ZP82 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC27.75■■■□□ 2.03
CCDC141Q6ZP82 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
CCDC141Q6ZP82 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
CCDC141Q6ZP82 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
CCDC141Q6ZP82 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CCDC141Q6ZP82 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
CCDC141Q6ZP82 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
CCDC141Q6ZP82 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CCDC141Q6ZP82 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CCDC141Q6ZP82 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
CCDC141Q6ZP82 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
CCDC141Q6ZP82 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CCDC141Q6ZP82 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
CCDC141Q6ZP82 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
CCDC141Q6ZP82 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
CCDC141Q6ZP82 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CCDC141Q6ZP82 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CCDC141Q6ZP82 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
CCDC141Q6ZP82 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CCDC141Q6ZP82 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CCDC141Q6ZP82 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CCDC141Q6ZP82 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
CCDC141Q6ZP82 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
CCDC141Q6ZP82 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
CCDC141Q6ZP82 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
CCDC141Q6ZP82 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
CCDC141Q6ZP82 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC27.74■■■□□ 2.03
CCDC141Q6ZP82 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CCDC141Q6ZP82 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CCDC141Q6ZP82 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CCDC141Q6ZP82 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
CCDC141Q6ZP82 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CCDC141Q6ZP82 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CCDC141Q6ZP82 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC27.74■■■□□ 2.03
CCDC141Q6ZP82 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
CCDC141Q6ZP82 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CCDC141Q6ZP82 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
CCDC141Q6ZP82 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
CCDC141Q6ZP82 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CCDC141Q6ZP82 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CCDC141Q6ZP82 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CCDC141Q6ZP82 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
CCDC141Q6ZP82 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.5 ms