Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZMZ3

SYNE3, Nesprin-3, humanhuman

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Length 975 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNE3Q6ZMZ3 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SYNE3Q6ZMZ3 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SYNE3Q6ZMZ3 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SYNE3Q6ZMZ3 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SYNE3Q6ZMZ3 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SYNE3Q6ZMZ3 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SYNE3Q6ZMZ3 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SYNE3Q6ZMZ3 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
SYNE3Q6ZMZ3 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SYNE3Q6ZMZ3 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SYNE3Q6ZMZ3 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SYNE3Q6ZMZ3 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SYNE3Q6ZMZ3 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SYNE3Q6ZMZ3 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SYNE3Q6ZMZ3 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SYNE3Q6ZMZ3 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SYNE3Q6ZMZ3 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SYNE3Q6ZMZ3 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SYNE3Q6ZMZ3 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SYNE3Q6ZMZ3 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SYNE3Q6ZMZ3 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SYNE3Q6ZMZ3 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SYNE3Q6ZMZ3 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SYNE3Q6ZMZ3 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
SYNE3Q6ZMZ3 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SYNE3Q6ZMZ3 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SYNE3Q6ZMZ3 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SYNE3Q6ZMZ3 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SYNE3Q6ZMZ3 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SYNE3Q6ZMZ3 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SYNE3Q6ZMZ3 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
SYNE3Q6ZMZ3 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SYNE3Q6ZMZ3 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
SYNE3Q6ZMZ3 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SYNE3Q6ZMZ3 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SYNE3Q6ZMZ3 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SYNE3Q6ZMZ3 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SYNE3Q6ZMZ3 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SYNE3Q6ZMZ3 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SYNE3Q6ZMZ3 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SYNE3Q6ZMZ3 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SYNE3Q6ZMZ3 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SYNE3Q6ZMZ3 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SYNE3Q6ZMZ3 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SYNE3Q6ZMZ3 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SYNE3Q6ZMZ3 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SYNE3Q6ZMZ3 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SYNE3Q6ZMZ3 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
SYNE3Q6ZMZ3 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SYNE3Q6ZMZ3 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SYNE3Q6ZMZ3 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SYNE3Q6ZMZ3 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SYNE3Q6ZMZ3 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SYNE3Q6ZMZ3 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
SYNE3Q6ZMZ3 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SYNE3Q6ZMZ3 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SYNE3Q6ZMZ3 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SYNE3Q6ZMZ3 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
SYNE3Q6ZMZ3 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SYNE3Q6ZMZ3 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SYNE3Q6ZMZ3 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SYNE3Q6ZMZ3 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SYNE3Q6ZMZ3 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SYNE3Q6ZMZ3 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SYNE3Q6ZMZ3 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SYNE3Q6ZMZ3 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SYNE3Q6ZMZ3 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SYNE3Q6ZMZ3 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
SYNE3Q6ZMZ3 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SYNE3Q6ZMZ3 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
SYNE3Q6ZMZ3 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SYNE3Q6ZMZ3 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SYNE3Q6ZMZ3 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SYNE3Q6ZMZ3 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
SYNE3Q6ZMZ3 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SYNE3Q6ZMZ3 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SYNE3Q6ZMZ3 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SYNE3Q6ZMZ3 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SYNE3Q6ZMZ3 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SYNE3Q6ZMZ3 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SYNE3Q6ZMZ3 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SYNE3Q6ZMZ3 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SYNE3Q6ZMZ3 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SYNE3Q6ZMZ3 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SYNE3Q6ZMZ3 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SYNE3Q6ZMZ3 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
SYNE3Q6ZMZ3 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SYNE3Q6ZMZ3 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SYNE3Q6ZMZ3 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SYNE3Q6ZMZ3 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SYNE3Q6ZMZ3 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SYNE3Q6ZMZ3 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SYNE3Q6ZMZ3 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
SYNE3Q6ZMZ3 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SYNE3Q6ZMZ3 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SYNE3Q6ZMZ3 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SYNE3Q6ZMZ3 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SYNE3Q6ZMZ3 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SYNE3Q6ZMZ3 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
SYNE3Q6ZMZ3 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
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