Protein–RNA interactions for Protein: Q6STE5

SMARCD3, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily D member 3, humanhuman

Predictions only

Length 483 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCD3Q6STE5 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SMARCD3Q6STE5 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SMARCD3Q6STE5 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SMARCD3Q6STE5 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SMARCD3Q6STE5 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
SMARCD3Q6STE5 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SMARCD3Q6STE5 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SMARCD3Q6STE5 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SMARCD3Q6STE5 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SMARCD3Q6STE5 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SMARCD3Q6STE5 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SMARCD3Q6STE5 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SMARCD3Q6STE5 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SMARCD3Q6STE5 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SMARCD3Q6STE5 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SMARCD3Q6STE5 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SMARCD3Q6STE5 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
SMARCD3Q6STE5 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SMARCD3Q6STE5 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SMARCD3Q6STE5 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SMARCD3Q6STE5 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SMARCD3Q6STE5 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SMARCD3Q6STE5 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SMARCD3Q6STE5 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SMARCD3Q6STE5 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SMARCD3Q6STE5 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SMARCD3Q6STE5 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SMARCD3Q6STE5 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SMARCD3Q6STE5 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SMARCD3Q6STE5 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SMARCD3Q6STE5 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SMARCD3Q6STE5 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SMARCD3Q6STE5 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SMARCD3Q6STE5 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SMARCD3Q6STE5 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SMARCD3Q6STE5 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SMARCD3Q6STE5 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SMARCD3Q6STE5 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SMARCD3Q6STE5 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SMARCD3Q6STE5 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SMARCD3Q6STE5 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SMARCD3Q6STE5 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SMARCD3Q6STE5 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SMARCD3Q6STE5 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SMARCD3Q6STE5 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SMARCD3Q6STE5 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SMARCD3Q6STE5 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SMARCD3Q6STE5 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SMARCD3Q6STE5 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SMARCD3Q6STE5 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SMARCD3Q6STE5 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
SMARCD3Q6STE5 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
SMARCD3Q6STE5 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
SMARCD3Q6STE5 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
SMARCD3Q6STE5 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
SMARCD3Q6STE5 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
SMARCD3Q6STE5 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
SMARCD3Q6STE5 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
SMARCD3Q6STE5 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
SMARCD3Q6STE5 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
SMARCD3Q6STE5 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
SMARCD3Q6STE5 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
SMARCD3Q6STE5 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
SMARCD3Q6STE5 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC17.02■□□□□ 0.31
SMARCD3Q6STE5 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
SMARCD3Q6STE5 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SMARCD3Q6STE5 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SMARCD3Q6STE5 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SMARCD3Q6STE5 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SMARCD3Q6STE5 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SMARCD3Q6STE5 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SMARCD3Q6STE5 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SMARCD3Q6STE5 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SMARCD3Q6STE5 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SMARCD3Q6STE5 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SMARCD3Q6STE5 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SMARCD3Q6STE5 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SMARCD3Q6STE5 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SMARCD3Q6STE5 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SMARCD3Q6STE5 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SMARCD3Q6STE5 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SMARCD3Q6STE5 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SMARCD3Q6STE5 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SMARCD3Q6STE5 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SMARCD3Q6STE5 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SMARCD3Q6STE5 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SMARCD3Q6STE5 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SMARCD3Q6STE5 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SMARCD3Q6STE5 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
SMARCD3Q6STE5 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SMARCD3Q6STE5 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SMARCD3Q6STE5 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SMARCD3Q6STE5 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SMARCD3Q6STE5 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SMARCD3Q6STE5 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SMARCD3Q6STE5 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SMARCD3Q6STE5 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SMARCD3Q6STE5 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SMARCD3Q6STE5 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SMARCD3Q6STE5 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms