Protein–RNA interactions for Protein: Q6QNY1

BLOC1S2, Biogenesis of lysosome-related organelles complex 1 subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BLOC1S2Q6QNY1 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
BLOC1S2Q6QNY1 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
BLOC1S2Q6QNY1 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
BLOC1S2Q6QNY1 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
BLOC1S2Q6QNY1 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
BLOC1S2Q6QNY1 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
BLOC1S2Q6QNY1 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
BLOC1S2Q6QNY1 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
BLOC1S2Q6QNY1 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
BLOC1S2Q6QNY1 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
BLOC1S2Q6QNY1 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
BLOC1S2Q6QNY1 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
BLOC1S2Q6QNY1 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
BLOC1S2Q6QNY1 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
BLOC1S2Q6QNY1 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
BLOC1S2Q6QNY1 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
BLOC1S2Q6QNY1 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
BLOC1S2Q6QNY1 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
BLOC1S2Q6QNY1 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
BLOC1S2Q6QNY1 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
BLOC1S2Q6QNY1 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
BLOC1S2Q6QNY1 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
BLOC1S2Q6QNY1 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
BLOC1S2Q6QNY1 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
BLOC1S2Q6QNY1 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
BLOC1S2Q6QNY1 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
BLOC1S2Q6QNY1 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
BLOC1S2Q6QNY1 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
BLOC1S2Q6QNY1 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
BLOC1S2Q6QNY1 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
BLOC1S2Q6QNY1 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
BLOC1S2Q6QNY1 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
BLOC1S2Q6QNY1 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
BLOC1S2Q6QNY1 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
BLOC1S2Q6QNY1 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
BLOC1S2Q6QNY1 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
BLOC1S2Q6QNY1 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
BLOC1S2Q6QNY1 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
BLOC1S2Q6QNY1 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
BLOC1S2Q6QNY1 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
BLOC1S2Q6QNY1 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
BLOC1S2Q6QNY1 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
BLOC1S2Q6QNY1 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
BLOC1S2Q6QNY1 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
BLOC1S2Q6QNY1 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
BLOC1S2Q6QNY1 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
BLOC1S2Q6QNY1 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
BLOC1S2Q6QNY1 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
BLOC1S2Q6QNY1 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
BLOC1S2Q6QNY1 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
BLOC1S2Q6QNY1 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
BLOC1S2Q6QNY1 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
BLOC1S2Q6QNY1 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
BLOC1S2Q6QNY1 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
BLOC1S2Q6QNY1 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
BLOC1S2Q6QNY1 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
BLOC1S2Q6QNY1 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
BLOC1S2Q6QNY1 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
BLOC1S2Q6QNY1 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
BLOC1S2Q6QNY1 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
BLOC1S2Q6QNY1 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
BLOC1S2Q6QNY1 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
BLOC1S2Q6QNY1 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
BLOC1S2Q6QNY1 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
BLOC1S2Q6QNY1 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
BLOC1S2Q6QNY1 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
BLOC1S2Q6QNY1 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
BLOC1S2Q6QNY1 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
BLOC1S2Q6QNY1 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
BLOC1S2Q6QNY1 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
BLOC1S2Q6QNY1 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
BLOC1S2Q6QNY1 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
BLOC1S2Q6QNY1 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
BLOC1S2Q6QNY1 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
BLOC1S2Q6QNY1 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
BLOC1S2Q6QNY1 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
BLOC1S2Q6QNY1 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
BLOC1S2Q6QNY1 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
BLOC1S2Q6QNY1 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
BLOC1S2Q6QNY1 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
BLOC1S2Q6QNY1 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
BLOC1S2Q6QNY1 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
BLOC1S2Q6QNY1 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
BLOC1S2Q6QNY1 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
BLOC1S2Q6QNY1 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
BLOC1S2Q6QNY1 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
BLOC1S2Q6QNY1 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
BLOC1S2Q6QNY1 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
BLOC1S2Q6QNY1 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
BLOC1S2Q6QNY1 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
BLOC1S2Q6QNY1 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
BLOC1S2Q6QNY1 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
BLOC1S2Q6QNY1 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
BLOC1S2Q6QNY1 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
BLOC1S2Q6QNY1 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
BLOC1S2Q6QNY1 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
BLOC1S2Q6QNY1 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
BLOC1S2Q6QNY1 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
BLOC1S2Q6QNY1 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
BLOC1S2Q6QNY1 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms