Protein–RNA interactions for Protein: Q6Q0C0

TRAF7, E3 ubiquitin-protein ligase TRAF7, humanhuman

Predictions only

Length 670 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF7Q6Q0C0 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TRAF7Q6Q0C0 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TRAF7Q6Q0C0 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TRAF7Q6Q0C0 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
TRAF7Q6Q0C0 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
TRAF7Q6Q0C0 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
TRAF7Q6Q0C0 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TRAF7Q6Q0C0 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
TRAF7Q6Q0C0 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
TRAF7Q6Q0C0 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
TRAF7Q6Q0C0 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
TRAF7Q6Q0C0 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TRAF7Q6Q0C0 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TRAF7Q6Q0C0 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TRAF7Q6Q0C0 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
TRAF7Q6Q0C0 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TRAF7Q6Q0C0 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
TRAF7Q6Q0C0 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
TRAF7Q6Q0C0 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TRAF7Q6Q0C0 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
TRAF7Q6Q0C0 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
TRAF7Q6Q0C0 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
TRAF7Q6Q0C0 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TRAF7Q6Q0C0 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TRAF7Q6Q0C0 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
TRAF7Q6Q0C0 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TRAF7Q6Q0C0 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
TRAF7Q6Q0C0 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
TRAF7Q6Q0C0 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TRAF7Q6Q0C0 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TRAF7Q6Q0C0 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TRAF7Q6Q0C0 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
TRAF7Q6Q0C0 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TRAF7Q6Q0C0 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TRAF7Q6Q0C0 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TRAF7Q6Q0C0 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
TRAF7Q6Q0C0 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TRAF7Q6Q0C0 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
TRAF7Q6Q0C0 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
TRAF7Q6Q0C0 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
TRAF7Q6Q0C0 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.28■□□□□ 0.84
TRAF7Q6Q0C0 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TRAF7Q6Q0C0 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
TRAF7Q6Q0C0 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
TRAF7Q6Q0C0 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
TRAF7Q6Q0C0 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
TRAF7Q6Q0C0 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
TRAF7Q6Q0C0 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TRAF7Q6Q0C0 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
TRAF7Q6Q0C0 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
TRAF7Q6Q0C0 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
TRAF7Q6Q0C0 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TRAF7Q6Q0C0 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
TRAF7Q6Q0C0 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
TRAF7Q6Q0C0 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
TRAF7Q6Q0C0 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
TRAF7Q6Q0C0 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
TRAF7Q6Q0C0 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
TRAF7Q6Q0C0 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
TRAF7Q6Q0C0 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
TRAF7Q6Q0C0 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
TRAF7Q6Q0C0 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
TRAF7Q6Q0C0 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
TRAF7Q6Q0C0 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
TRAF7Q6Q0C0 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC20.27■□□□□ 0.84
TRAF7Q6Q0C0 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
TRAF7Q6Q0C0 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
TRAF7Q6Q0C0 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
TRAF7Q6Q0C0 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
TRAF7Q6Q0C0 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
TRAF7Q6Q0C0 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
TRAF7Q6Q0C0 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
TRAF7Q6Q0C0 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
TRAF7Q6Q0C0 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
TRAF7Q6Q0C0 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
TRAF7Q6Q0C0 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC20.27■□□□□ 0.83
TRAF7Q6Q0C0 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC20.27■□□□□ 0.83
TRAF7Q6Q0C0 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
TRAF7Q6Q0C0 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC20.27■□□□□ 0.83
TRAF7Q6Q0C0 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
TRAF7Q6Q0C0 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
TRAF7Q6Q0C0 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TRAF7Q6Q0C0 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
TRAF7Q6Q0C0 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
TRAF7Q6Q0C0 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TRAF7Q6Q0C0 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TRAF7Q6Q0C0 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TRAF7Q6Q0C0 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
TRAF7Q6Q0C0 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TRAF7Q6Q0C0 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
TRAF7Q6Q0C0 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
TRAF7Q6Q0C0 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
TRAF7Q6Q0C0 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC20.26■□□□□ 0.83
TRAF7Q6Q0C0 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TRAF7Q6Q0C0 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
TRAF7Q6Q0C0 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TRAF7Q6Q0C0 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
TRAF7Q6Q0C0 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TRAF7Q6Q0C0 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
TRAF7Q6Q0C0 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.1 ms