Protein–RNA interactions for Protein: Q6PII3

CCDC174, Coiled-coil domain-containing protein 174, humanhuman

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC174Q6PII3 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC174Q6PII3 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC174Q6PII3 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC174Q6PII3 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC174Q6PII3 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC174Q6PII3 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC174Q6PII3 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC174Q6PII3 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC174Q6PII3 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC174Q6PII3 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC174Q6PII3 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC174Q6PII3 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC174Q6PII3 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC174Q6PII3 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC174Q6PII3 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC174Q6PII3 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC174Q6PII3 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC174Q6PII3 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC174Q6PII3 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC174Q6PII3 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC174Q6PII3 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC174Q6PII3 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC174Q6PII3 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC174Q6PII3 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC174Q6PII3 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC174Q6PII3 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC174Q6PII3 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC174Q6PII3 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC174Q6PII3 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC174Q6PII3 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC174Q6PII3 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC174Q6PII3 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC174Q6PII3 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC174Q6PII3 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC174Q6PII3 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC174Q6PII3 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC174Q6PII3 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC174Q6PII3 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC174Q6PII3 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC174Q6PII3 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC174Q6PII3 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC174Q6PII3 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC174Q6PII3 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC174Q6PII3 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC174Q6PII3 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC174Q6PII3 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC174Q6PII3 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC174Q6PII3 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC174Q6PII3 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC174Q6PII3 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC174Q6PII3 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC174Q6PII3 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC174Q6PII3 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC174Q6PII3 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC174Q6PII3 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC174Q6PII3 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC174Q6PII3 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC174Q6PII3 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC174Q6PII3 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC174Q6PII3 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC174Q6PII3 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC174Q6PII3 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC174Q6PII3 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC174Q6PII3 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
CCDC174Q6PII3 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC174Q6PII3 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC174Q6PII3 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC174Q6PII3 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC174Q6PII3 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC174Q6PII3 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC174Q6PII3 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC174Q6PII3 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC174Q6PII3 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC174Q6PII3 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC174Q6PII3 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC174Q6PII3 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC174Q6PII3 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC174Q6PII3 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC174Q6PII3 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC174Q6PII3 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC174Q6PII3 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC174Q6PII3 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC174Q6PII3 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC174Q6PII3 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC174Q6PII3 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC174Q6PII3 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC174Q6PII3 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC174Q6PII3 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC174Q6PII3 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC174Q6PII3 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC174Q6PII3 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC174Q6PII3 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC174Q6PII3 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC174Q6PII3 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC174Q6PII3 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC174Q6PII3 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC174Q6PII3 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC174Q6PII3 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC174Q6PII3 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC174Q6PII3 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms