Protein–RNA interactions for Protein: Q6PD62

CTR9, RNA polymerase-associated protein CTR9 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTR9Q6PD62 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CTR9Q6PD62 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
CTR9Q6PD62 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CTR9Q6PD62 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CTR9Q6PD62 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CTR9Q6PD62 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CTR9Q6PD62 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CTR9Q6PD62 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CTR9Q6PD62 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CTR9Q6PD62 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CTR9Q6PD62 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CTR9Q6PD62 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CTR9Q6PD62 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CTR9Q6PD62 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CTR9Q6PD62 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CTR9Q6PD62 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CTR9Q6PD62 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CTR9Q6PD62 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
CTR9Q6PD62 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CTR9Q6PD62 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CTR9Q6PD62 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
CTR9Q6PD62 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
CTR9Q6PD62 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CTR9Q6PD62 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CTR9Q6PD62 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CTR9Q6PD62 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CTR9Q6PD62 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CTR9Q6PD62 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CTR9Q6PD62 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CTR9Q6PD62 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CTR9Q6PD62 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CTR9Q6PD62 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CTR9Q6PD62 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CTR9Q6PD62 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CTR9Q6PD62 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CTR9Q6PD62 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CTR9Q6PD62 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CTR9Q6PD62 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CTR9Q6PD62 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
CTR9Q6PD62 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CTR9Q6PD62 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
CTR9Q6PD62 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CTR9Q6PD62 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CTR9Q6PD62 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
CTR9Q6PD62 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CTR9Q6PD62 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CTR9Q6PD62 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CTR9Q6PD62 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
CTR9Q6PD62 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CTR9Q6PD62 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CTR9Q6PD62 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CTR9Q6PD62 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CTR9Q6PD62 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CTR9Q6PD62 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CTR9Q6PD62 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CTR9Q6PD62 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
CTR9Q6PD62 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CTR9Q6PD62 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CTR9Q6PD62 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CTR9Q6PD62 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CTR9Q6PD62 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CTR9Q6PD62 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
CTR9Q6PD62 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CTR9Q6PD62 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CTR9Q6PD62 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CTR9Q6PD62 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CTR9Q6PD62 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CTR9Q6PD62 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CTR9Q6PD62 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CTR9Q6PD62 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CTR9Q6PD62 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CTR9Q6PD62 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CTR9Q6PD62 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CTR9Q6PD62 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CTR9Q6PD62 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CTR9Q6PD62 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CTR9Q6PD62 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CTR9Q6PD62 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CTR9Q6PD62 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CTR9Q6PD62 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CTR9Q6PD62 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CTR9Q6PD62 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CTR9Q6PD62 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CTR9Q6PD62 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CTR9Q6PD62 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CTR9Q6PD62 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
CTR9Q6PD62 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CTR9Q6PD62 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CTR9Q6PD62 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CTR9Q6PD62 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CTR9Q6PD62 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CTR9Q6PD62 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
CTR9Q6PD62 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CTR9Q6PD62 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CTR9Q6PD62 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CTR9Q6PD62 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CTR9Q6PD62 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CTR9Q6PD62 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CTR9Q6PD62 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CTR9Q6PD62 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45 ms