Protein–RNA interactions for Protein: Q5VYK3

ECM29, Proteasome-associated protein ECM29 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,845 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECM29Q5VYK3 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ECM29Q5VYK3 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ECM29Q5VYK3 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ECM29Q5VYK3 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ECM29Q5VYK3 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ECM29Q5VYK3 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ECM29Q5VYK3 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ECM29Q5VYK3 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ECM29Q5VYK3 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ECM29Q5VYK3 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ECM29Q5VYK3 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ECM29Q5VYK3 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ECM29Q5VYK3 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ECM29Q5VYK3 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ECM29Q5VYK3 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ECM29Q5VYK3 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ECM29Q5VYK3 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
ECM29Q5VYK3 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ECM29Q5VYK3 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ECM29Q5VYK3 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ECM29Q5VYK3 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ECM29Q5VYK3 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ECM29Q5VYK3 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ECM29Q5VYK3 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ECM29Q5VYK3 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ECM29Q5VYK3 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ECM29Q5VYK3 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
ECM29Q5VYK3 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ECM29Q5VYK3 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ECM29Q5VYK3 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ECM29Q5VYK3 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ECM29Q5VYK3 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ECM29Q5VYK3 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
ECM29Q5VYK3 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ECM29Q5VYK3 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ECM29Q5VYK3 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ECM29Q5VYK3 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ECM29Q5VYK3 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
ECM29Q5VYK3 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ECM29Q5VYK3 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ECM29Q5VYK3 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ECM29Q5VYK3 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
ECM29Q5VYK3 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ECM29Q5VYK3 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ECM29Q5VYK3 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
ECM29Q5VYK3 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ECM29Q5VYK3 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ECM29Q5VYK3 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ECM29Q5VYK3 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ECM29Q5VYK3 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ECM29Q5VYK3 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ECM29Q5VYK3 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ECM29Q5VYK3 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ECM29Q5VYK3 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ECM29Q5VYK3 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ECM29Q5VYK3 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ECM29Q5VYK3 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ECM29Q5VYK3 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ECM29Q5VYK3 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ECM29Q5VYK3 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ECM29Q5VYK3 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ECM29Q5VYK3 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ECM29Q5VYK3 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ECM29Q5VYK3 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ECM29Q5VYK3 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
ECM29Q5VYK3 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ECM29Q5VYK3 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ECM29Q5VYK3 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ECM29Q5VYK3 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ECM29Q5VYK3 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ECM29Q5VYK3 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
ECM29Q5VYK3 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ECM29Q5VYK3 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ECM29Q5VYK3 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ECM29Q5VYK3 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
ECM29Q5VYK3 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ECM29Q5VYK3 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ECM29Q5VYK3 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ECM29Q5VYK3 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ECM29Q5VYK3 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ECM29Q5VYK3 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
ECM29Q5VYK3 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ECM29Q5VYK3 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ECM29Q5VYK3 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ECM29Q5VYK3 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ECM29Q5VYK3 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ECM29Q5VYK3 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ECM29Q5VYK3 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ECM29Q5VYK3 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ECM29Q5VYK3 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ECM29Q5VYK3 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ECM29Q5VYK3 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ECM29Q5VYK3 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ECM29Q5VYK3 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ECM29Q5VYK3 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
ECM29Q5VYK3 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
ECM29Q5VYK3 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
ECM29Q5VYK3 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ECM29Q5VYK3 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ECM29Q5VYK3 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms