Protein–RNA interactions for Protein: Q5VX71

SUSD4, Sushi domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 490 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUSD4Q5VX71 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SUSD4Q5VX71 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SUSD4Q5VX71 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SUSD4Q5VX71 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SUSD4Q5VX71 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SUSD4Q5VX71 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SUSD4Q5VX71 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SUSD4Q5VX71 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SUSD4Q5VX71 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SUSD4Q5VX71 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SUSD4Q5VX71 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SUSD4Q5VX71 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SUSD4Q5VX71 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
SUSD4Q5VX71 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SUSD4Q5VX71 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SUSD4Q5VX71 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SUSD4Q5VX71 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SUSD4Q5VX71 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SUSD4Q5VX71 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SUSD4Q5VX71 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SUSD4Q5VX71 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SUSD4Q5VX71 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SUSD4Q5VX71 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SUSD4Q5VX71 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SUSD4Q5VX71 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SUSD4Q5VX71 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SUSD4Q5VX71 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SUSD4Q5VX71 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SUSD4Q5VX71 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SUSD4Q5VX71 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SUSD4Q5VX71 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SUSD4Q5VX71 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SUSD4Q5VX71 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SUSD4Q5VX71 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SUSD4Q5VX71 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SUSD4Q5VX71 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SUSD4Q5VX71 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SUSD4Q5VX71 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SUSD4Q5VX71 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SUSD4Q5VX71 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SUSD4Q5VX71 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SUSD4Q5VX71 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SUSD4Q5VX71 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SUSD4Q5VX71 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
SUSD4Q5VX71 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SUSD4Q5VX71 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SUSD4Q5VX71 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SUSD4Q5VX71 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SUSD4Q5VX71 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SUSD4Q5VX71 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
SUSD4Q5VX71 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
SUSD4Q5VX71 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SUSD4Q5VX71 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SUSD4Q5VX71 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SUSD4Q5VX71 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SUSD4Q5VX71 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SUSD4Q5VX71 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SUSD4Q5VX71 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SUSD4Q5VX71 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
SUSD4Q5VX71 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
SUSD4Q5VX71 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
SUSD4Q5VX71 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
SUSD4Q5VX71 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
SUSD4Q5VX71 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SUSD4Q5VX71 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SUSD4Q5VX71 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
SUSD4Q5VX71 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SUSD4Q5VX71 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SUSD4Q5VX71 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SUSD4Q5VX71 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SUSD4Q5VX71 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SUSD4Q5VX71 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SUSD4Q5VX71 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SUSD4Q5VX71 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SUSD4Q5VX71 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SUSD4Q5VX71 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SUSD4Q5VX71 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SUSD4Q5VX71 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SUSD4Q5VX71 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SUSD4Q5VX71 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
SUSD4Q5VX71 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SUSD4Q5VX71 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SUSD4Q5VX71 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SUSD4Q5VX71 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
SUSD4Q5VX71 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SUSD4Q5VX71 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SUSD4Q5VX71 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SUSD4Q5VX71 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SUSD4Q5VX71 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SUSD4Q5VX71 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SUSD4Q5VX71 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
SUSD4Q5VX71 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SUSD4Q5VX71 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SUSD4Q5VX71 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SUSD4Q5VX71 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SUSD4Q5VX71 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SUSD4Q5VX71 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SUSD4Q5VX71 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SUSD4Q5VX71 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SUSD4Q5VX71 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.9 ms