Protein–RNA interactions for Protein: Q5T7P8

SYT6, Synaptotagmin-6, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 510 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYT6Q5T7P8 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SYT6Q5T7P8 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SYT6Q5T7P8 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SYT6Q5T7P8 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
SYT6Q5T7P8 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SYT6Q5T7P8 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
SYT6Q5T7P8 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SYT6Q5T7P8 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SYT6Q5T7P8 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SYT6Q5T7P8 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SYT6Q5T7P8 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SYT6Q5T7P8 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SYT6Q5T7P8 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SYT6Q5T7P8 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SYT6Q5T7P8 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SYT6Q5T7P8 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SYT6Q5T7P8 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SYT6Q5T7P8 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SYT6Q5T7P8 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SYT6Q5T7P8 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SYT6Q5T7P8 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SYT6Q5T7P8 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
SYT6Q5T7P8 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SYT6Q5T7P8 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
SYT6Q5T7P8 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SYT6Q5T7P8 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SYT6Q5T7P8 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SYT6Q5T7P8 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SYT6Q5T7P8 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SYT6Q5T7P8 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
SYT6Q5T7P8 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SYT6Q5T7P8 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SYT6Q5T7P8 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SYT6Q5T7P8 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
SYT6Q5T7P8 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SYT6Q5T7P8 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SYT6Q5T7P8 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
SYT6Q5T7P8 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SYT6Q5T7P8 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SYT6Q5T7P8 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SYT6Q5T7P8 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SYT6Q5T7P8 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SYT6Q5T7P8 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SYT6Q5T7P8 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SYT6Q5T7P8 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SYT6Q5T7P8 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SYT6Q5T7P8 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SYT6Q5T7P8 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SYT6Q5T7P8 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SYT6Q5T7P8 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SYT6Q5T7P8 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SYT6Q5T7P8 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SYT6Q5T7P8 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
SYT6Q5T7P8 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SYT6Q5T7P8 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SYT6Q5T7P8 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
SYT6Q5T7P8 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
SYT6Q5T7P8 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SYT6Q5T7P8 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SYT6Q5T7P8 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SYT6Q5T7P8 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
SYT6Q5T7P8 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SYT6Q5T7P8 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SYT6Q5T7P8 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SYT6Q5T7P8 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SYT6Q5T7P8 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SYT6Q5T7P8 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SYT6Q5T7P8 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SYT6Q5T7P8 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SYT6Q5T7P8 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
SYT6Q5T7P8 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SYT6Q5T7P8 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SYT6Q5T7P8 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SYT6Q5T7P8 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SYT6Q5T7P8 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SYT6Q5T7P8 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SYT6Q5T7P8 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SYT6Q5T7P8 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SYT6Q5T7P8 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SYT6Q5T7P8 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SYT6Q5T7P8 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SYT6Q5T7P8 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SYT6Q5T7P8 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SYT6Q5T7P8 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SYT6Q5T7P8 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SYT6Q5T7P8 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SYT6Q5T7P8 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SYT6Q5T7P8 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SYT6Q5T7P8 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SYT6Q5T7P8 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SYT6Q5T7P8 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SYT6Q5T7P8 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SYT6Q5T7P8 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SYT6Q5T7P8 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SYT6Q5T7P8 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SYT6Q5T7P8 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
SYT6Q5T7P8 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SYT6Q5T7P8 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SYT6Q5T7P8 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SYT6Q5T7P8 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms