Protein–RNA interactions for Protein: Q5SYE7

NHSL1, NHS-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,610 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NHSL1Q5SYE7 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
NHSL1Q5SYE7 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
NHSL1Q5SYE7 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
NHSL1Q5SYE7 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
NHSL1Q5SYE7 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
NHSL1Q5SYE7 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
NHSL1Q5SYE7 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
NHSL1Q5SYE7 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
NHSL1Q5SYE7 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
NHSL1Q5SYE7 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
NHSL1Q5SYE7 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
NHSL1Q5SYE7 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
NHSL1Q5SYE7 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
NHSL1Q5SYE7 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
NHSL1Q5SYE7 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
NHSL1Q5SYE7 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
NHSL1Q5SYE7 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
NHSL1Q5SYE7 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
NHSL1Q5SYE7 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC25.14■■□□□ 1.61
NHSL1Q5SYE7 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
NHSL1Q5SYE7 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
NHSL1Q5SYE7 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
NHSL1Q5SYE7 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
NHSL1Q5SYE7 AL035633.1-201ENST00000406139 838 ntBASIC25.14■■□□□ 1.61
NHSL1Q5SYE7 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.61
NHSL1Q5SYE7 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
NHSL1Q5SYE7 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC25.14■■□□□ 1.61
NHSL1Q5SYE7 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.61
NHSL1Q5SYE7 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC25.14■■□□□ 1.61
NHSL1Q5SYE7 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.61
NHSL1Q5SYE7 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
NHSL1Q5SYE7 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC25.14■■□□□ 1.61
NHSL1Q5SYE7 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
NHSL1Q5SYE7 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
NHSL1Q5SYE7 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
NHSL1Q5SYE7 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
NHSL1Q5SYE7 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
NHSL1Q5SYE7 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
NHSL1Q5SYE7 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
NHSL1Q5SYE7 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
NHSL1Q5SYE7 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
NHSL1Q5SYE7 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
NHSL1Q5SYE7 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
NHSL1Q5SYE7 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
NHSL1Q5SYE7 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
NHSL1Q5SYE7 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
NHSL1Q5SYE7 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
NHSL1Q5SYE7 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
NHSL1Q5SYE7 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
NHSL1Q5SYE7 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
NHSL1Q5SYE7 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
NHSL1Q5SYE7 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
NHSL1Q5SYE7 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
NHSL1Q5SYE7 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
NHSL1Q5SYE7 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
NHSL1Q5SYE7 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
NHSL1Q5SYE7 S100A6-205ENST00000496817 673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
NHSL1Q5SYE7 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
NHSL1Q5SYE7 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
NHSL1Q5SYE7 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
NHSL1Q5SYE7 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
NHSL1Q5SYE7 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
NHSL1Q5SYE7 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
NHSL1Q5SYE7 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
NHSL1Q5SYE7 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
NHSL1Q5SYE7 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC25.12■■□□□ 1.61
NHSL1Q5SYE7 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
NHSL1Q5SYE7 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
NHSL1Q5SYE7 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
NHSL1Q5SYE7 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
NHSL1Q5SYE7 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
NHSL1Q5SYE7 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
NHSL1Q5SYE7 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
NHSL1Q5SYE7 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
NHSL1Q5SYE7 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
NHSL1Q5SYE7 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
NHSL1Q5SYE7 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
NHSL1Q5SYE7 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
NHSL1Q5SYE7 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
NHSL1Q5SYE7 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
NHSL1Q5SYE7 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
NHSL1Q5SYE7 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
NHSL1Q5SYE7 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
NHSL1Q5SYE7 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
NHSL1Q5SYE7 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
NHSL1Q5SYE7 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
NHSL1Q5SYE7 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
NHSL1Q5SYE7 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
NHSL1Q5SYE7 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
NHSL1Q5SYE7 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
NHSL1Q5SYE7 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
NHSL1Q5SYE7 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
NHSL1Q5SYE7 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
NHSL1Q5SYE7 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
NHSL1Q5SYE7 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
NHSL1Q5SYE7 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
NHSL1Q5SYE7 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
NHSL1Q5SYE7 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
NHSL1Q5SYE7 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
NHSL1Q5SYE7 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms