Protein–RNA interactions for Protein: Q587J7

TDRD12, Putative ATP-dependent RNA helicase TDRD12, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,177 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TDRD12Q587J7 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TDRD12Q587J7 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TDRD12Q587J7 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TDRD12Q587J7 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
TDRD12Q587J7 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TDRD12Q587J7 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TDRD12Q587J7 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TDRD12Q587J7 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
TDRD12Q587J7 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TDRD12Q587J7 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TDRD12Q587J7 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TDRD12Q587J7 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TDRD12Q587J7 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TDRD12Q587J7 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TDRD12Q587J7 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
TDRD12Q587J7 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TDRD12Q587J7 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
TDRD12Q587J7 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TDRD12Q587J7 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TDRD12Q587J7 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TDRD12Q587J7 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TDRD12Q587J7 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TDRD12Q587J7 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TDRD12Q587J7 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TDRD12Q587J7 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TDRD12Q587J7 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TDRD12Q587J7 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TDRD12Q587J7 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TDRD12Q587J7 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TDRD12Q587J7 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TDRD12Q587J7 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TDRD12Q587J7 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TDRD12Q587J7 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TDRD12Q587J7 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TDRD12Q587J7 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TDRD12Q587J7 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TDRD12Q587J7 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TDRD12Q587J7 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TDRD12Q587J7 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TDRD12Q587J7 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
TDRD12Q587J7 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TDRD12Q587J7 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
TDRD12Q587J7 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TDRD12Q587J7 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TDRD12Q587J7 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TDRD12Q587J7 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
TDRD12Q587J7 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TDRD12Q587J7 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TDRD12Q587J7 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TDRD12Q587J7 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TDRD12Q587J7 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TDRD12Q587J7 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TDRD12Q587J7 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TDRD12Q587J7 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TDRD12Q587J7 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TDRD12Q587J7 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TDRD12Q587J7 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TDRD12Q587J7 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TDRD12Q587J7 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TDRD12Q587J7 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TDRD12Q587J7 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TDRD12Q587J7 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TDRD12Q587J7 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TDRD12Q587J7 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TDRD12Q587J7 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
TDRD12Q587J7 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TDRD12Q587J7 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TDRD12Q587J7 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TDRD12Q587J7 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TDRD12Q587J7 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TDRD12Q587J7 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TDRD12Q587J7 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TDRD12Q587J7 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TDRD12Q587J7 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TDRD12Q587J7 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TDRD12Q587J7 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TDRD12Q587J7 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TDRD12Q587J7 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TDRD12Q587J7 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TDRD12Q587J7 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TDRD12Q587J7 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TDRD12Q587J7 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TDRD12Q587J7 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TDRD12Q587J7 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TDRD12Q587J7 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TDRD12Q587J7 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TDRD12Q587J7 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TDRD12Q587J7 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TDRD12Q587J7 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TDRD12Q587J7 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TDRD12Q587J7 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TDRD12Q587J7 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TDRD12Q587J7 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TDRD12Q587J7 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TDRD12Q587J7 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
TDRD12Q587J7 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
TDRD12Q587J7 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TDRD12Q587J7 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TDRD12Q587J7 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TDRD12Q587J7 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms