Protein–RNA interactions for Protein: Q53RE8

ANKRD39, Ankyrin repeat domain-containing protein 39, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD39Q53RE8 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
ANKRD39Q53RE8 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
ANKRD39Q53RE8 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
ANKRD39Q53RE8 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
ANKRD39Q53RE8 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
ANKRD39Q53RE8 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
ANKRD39Q53RE8 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
ANKRD39Q53RE8 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
ANKRD39Q53RE8 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
ANKRD39Q53RE8 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
ANKRD39Q53RE8 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
ANKRD39Q53RE8 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
ANKRD39Q53RE8 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
ANKRD39Q53RE8 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
ANKRD39Q53RE8 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
ANKRD39Q53RE8 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
ANKRD39Q53RE8 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
ANKRD39Q53RE8 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
ANKRD39Q53RE8 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
ANKRD39Q53RE8 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
ANKRD39Q53RE8 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
ANKRD39Q53RE8 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
ANKRD39Q53RE8 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
ANKRD39Q53RE8 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
ANKRD39Q53RE8 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
ANKRD39Q53RE8 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
ANKRD39Q53RE8 XRCC1-201ENST00000262887 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
ANKRD39Q53RE8 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
ANKRD39Q53RE8 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
ANKRD39Q53RE8 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
ANKRD39Q53RE8 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
ANKRD39Q53RE8 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
ANKRD39Q53RE8 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
ANKRD39Q53RE8 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
ANKRD39Q53RE8 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
ANKRD39Q53RE8 DMPK-202ENST00000343373 3227 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
ANKRD39Q53RE8 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
ANKRD39Q53RE8 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
ANKRD39Q53RE8 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
ANKRD39Q53RE8 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
ANKRD39Q53RE8 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
ANKRD39Q53RE8 SYT5-201ENST00000354308 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
ANKRD39Q53RE8 TNFSF13-203ENST00000380535 2195 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
ANKRD39Q53RE8 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
ANKRD39Q53RE8 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
ANKRD39Q53RE8 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
ANKRD39Q53RE8 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
ANKRD39Q53RE8 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
ANKRD39Q53RE8 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
ANKRD39Q53RE8 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
ANKRD39Q53RE8 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
ANKRD39Q53RE8 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
ANKRD39Q53RE8 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
ANKRD39Q53RE8 CARHSP1-216ENST00000610831 2841 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
ANKRD39Q53RE8 CARHSP1-217ENST00000611932 2833 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
ANKRD39Q53RE8 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
ANKRD39Q53RE8 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
ANKRD39Q53RE8 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
ANKRD39Q53RE8 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
ANKRD39Q53RE8 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
ANKRD39Q53RE8 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
ANKRD39Q53RE8 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
ANKRD39Q53RE8 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
ANKRD39Q53RE8 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
ANKRD39Q53RE8 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
ANKRD39Q53RE8 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
ANKRD39Q53RE8 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
ANKRD39Q53RE8 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
ANKRD39Q53RE8 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
ANKRD39Q53RE8 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
ANKRD39Q53RE8 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
ANKRD39Q53RE8 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
ANKRD39Q53RE8 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.27
ANKRD39Q53RE8 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.27
ANKRD39Q53RE8 C22orf34-204ENST00000414287 2197 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
ANKRD39Q53RE8 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
ANKRD39Q53RE8 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
ANKRD39Q53RE8 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
ANKRD39Q53RE8 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
ANKRD39Q53RE8 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
ANKRD39Q53RE8 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
ANKRD39Q53RE8 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
ANKRD39Q53RE8 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
ANKRD39Q53RE8 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
ANKRD39Q53RE8 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
ANKRD39Q53RE8 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
ANKRD39Q53RE8 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
ANKRD39Q53RE8 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
ANKRD39Q53RE8 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
ANKRD39Q53RE8 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
ANKRD39Q53RE8 FAM214B-202ENST00000378557 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
ANKRD39Q53RE8 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
ANKRD39Q53RE8 TAF5-201ENST00000369839 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
ANKRD39Q53RE8 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
ANKRD39Q53RE8 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
ANKRD39Q53RE8 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
ANKRD39Q53RE8 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
ANKRD39Q53RE8 VPS9D1-201ENST00000389386 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
ANKRD39Q53RE8 ARVCF-202ENST00000401994 2700 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
ANKRD39Q53RE8 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms