Protein–RNA interactions for Protein: Q3LI61

KRTAP20-2, Keratin-associated protein 20-2, humanhuman

Predictions only

Length 65 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP20-2Q3LI61 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
KRTAP20-2Q3LI61 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC5.41□□□□□ -1.54
KRTAP20-2Q3LI61 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
KRTAP20-2Q3LI61 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC5.41□□□□□ -1.54
KRTAP20-2Q3LI61 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
KRTAP20-2Q3LI61 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
KRTAP20-2Q3LI61 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
KRTAP20-2Q3LI61 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC5.41□□□□□ -1.54
KRTAP20-2Q3LI61 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
KRTAP20-2Q3LI61 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
KRTAP20-2Q3LI61 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
KRTAP20-2Q3LI61 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
KRTAP20-2Q3LI61 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
KRTAP20-2Q3LI61 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
KRTAP20-2Q3LI61 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
KRTAP20-2Q3LI61 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
KRTAP20-2Q3LI61 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
KRTAP20-2Q3LI61 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
KRTAP20-2Q3LI61 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
KRTAP20-2Q3LI61 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC5.41□□□□□ -1.54
KRTAP20-2Q3LI61 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC5.41□□□□□ -1.54
KRTAP20-2Q3LI61 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
KRTAP20-2Q3LI61 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
KRTAP20-2Q3LI61 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
KRTAP20-2Q3LI61 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
KRTAP20-2Q3LI61 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
KRTAP20-2Q3LI61 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
KRTAP20-2Q3LI61 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
KRTAP20-2Q3LI61 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
KRTAP20-2Q3LI61 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC5.41□□□□□ -1.54
KRTAP20-2Q3LI61 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC5.41□□□□□ -1.54
KRTAP20-2Q3LI61 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
KRTAP20-2Q3LI61 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC5.41□□□□□ -1.54
KRTAP20-2Q3LI61 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
KRTAP20-2Q3LI61 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.41□□□□□ -1.54
KRTAP20-2Q3LI61 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC5.41□□□□□ -1.54
KRTAP20-2Q3LI61 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
KRTAP20-2Q3LI61 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
KRTAP20-2Q3LI61 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC5.41□□□□□ -1.54
KRTAP20-2Q3LI61 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
KRTAP20-2Q3LI61 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC5.41□□□□□ -1.54
KRTAP20-2Q3LI61 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC5.41□□□□□ -1.54
KRTAP20-2Q3LI61 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
KRTAP20-2Q3LI61 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
KRTAP20-2Q3LI61 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
KRTAP20-2Q3LI61 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
KRTAP20-2Q3LI61 STMN4-207ENST00000523048 1224 ntTSL 2 BASIC5.41□□□□□ -1.54
KRTAP20-2Q3LI61 AC055854.1-201ENST00000523627 570 ntTSL 4 BASIC5.41□□□□□ -1.54
KRTAP20-2Q3LI61 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
KRTAP20-2Q3LI61 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
KRTAP20-2Q3LI61 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC5.41□□□□□ -1.54
KRTAP20-2Q3LI61 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.41□□□□□ -1.54
KRTAP20-2Q3LI61 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC5.41□□□□□ -1.54
KRTAP20-2Q3LI61 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC5.41□□□□□ -1.54
KRTAP20-2Q3LI61 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC5.41□□□□□ -1.54
KRTAP20-2Q3LI61 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.41□□□□□ -1.54
KRTAP20-2Q3LI61 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
KRTAP20-2Q3LI61 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC5.41□□□□□ -1.54
KRTAP20-2Q3LI61 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
KRTAP20-2Q3LI61 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
KRTAP20-2Q3LI61 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
KRTAP20-2Q3LI61 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
KRTAP20-2Q3LI61 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
KRTAP20-2Q3LI61 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
KRTAP20-2Q3LI61 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC5.41□□□□□ -1.54
KRTAP20-2Q3LI61 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
KRTAP20-2Q3LI61 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.41□□□□□ -1.54
KRTAP20-2Q3LI61 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC5.41□□□□□ -1.54
KRTAP20-2Q3LI61 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
KRTAP20-2Q3LI61 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
KRTAP20-2Q3LI61 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
KRTAP20-2Q3LI61 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
KRTAP20-2Q3LI61 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC5.41□□□□□ -1.54
KRTAP20-2Q3LI61 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC5.41□□□□□ -1.54
KRTAP20-2Q3LI61 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
KRTAP20-2Q3LI61 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
KRTAP20-2Q3LI61 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
KRTAP20-2Q3LI61 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.41□□□□□ -1.54
KRTAP20-2Q3LI61 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
KRTAP20-2Q3LI61 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
KRTAP20-2Q3LI61 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
KRTAP20-2Q3LI61 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
KRTAP20-2Q3LI61 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
KRTAP20-2Q3LI61 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC5.41□□□□□ -1.54
KRTAP20-2Q3LI61 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
KRTAP20-2Q3LI61 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC5.41□□□□□ -1.54
KRTAP20-2Q3LI61 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
KRTAP20-2Q3LI61 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.54
KRTAP20-2Q3LI61 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
KRTAP20-2Q3LI61 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
KRTAP20-2Q3LI61 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC5.4□□□□□ -1.54
KRTAP20-2Q3LI61 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
KRTAP20-2Q3LI61 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
KRTAP20-2Q3LI61 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
KRTAP20-2Q3LI61 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
KRTAP20-2Q3LI61 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.54
KRTAP20-2Q3LI61 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
KRTAP20-2Q3LI61 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC5.4□□□□□ -1.54
KRTAP20-2Q3LI61 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
KRTAP20-2Q3LI61 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms