Protein–RNA interactions for Protein: Q3B726

TWISTNB, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA43, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TWISTNBQ3B726 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
TWISTNBQ3B726 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TWISTNBQ3B726 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TWISTNBQ3B726 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TWISTNBQ3B726 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TWISTNBQ3B726 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TWISTNBQ3B726 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TWISTNBQ3B726 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TWISTNBQ3B726 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TWISTNBQ3B726 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TWISTNBQ3B726 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TWISTNBQ3B726 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TWISTNBQ3B726 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TWISTNBQ3B726 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TWISTNBQ3B726 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TWISTNBQ3B726 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TWISTNBQ3B726 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TWISTNBQ3B726 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TWISTNBQ3B726 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TWISTNBQ3B726 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TWISTNBQ3B726 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TWISTNBQ3B726 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TWISTNBQ3B726 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TWISTNBQ3B726 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
TWISTNBQ3B726 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TWISTNBQ3B726 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TWISTNBQ3B726 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
TWISTNBQ3B726 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TWISTNBQ3B726 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TWISTNBQ3B726 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TWISTNBQ3B726 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TWISTNBQ3B726 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TWISTNBQ3B726 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TWISTNBQ3B726 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TWISTNBQ3B726 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TWISTNBQ3B726 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TWISTNBQ3B726 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TWISTNBQ3B726 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TWISTNBQ3B726 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TWISTNBQ3B726 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
TWISTNBQ3B726 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
TWISTNBQ3B726 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
TWISTNBQ3B726 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
TWISTNBQ3B726 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
TWISTNBQ3B726 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
TWISTNBQ3B726 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
TWISTNBQ3B726 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
TWISTNBQ3B726 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
TWISTNBQ3B726 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.41
TWISTNBQ3B726 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
TWISTNBQ3B726 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
TWISTNBQ3B726 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
TWISTNBQ3B726 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
TWISTNBQ3B726 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
TWISTNBQ3B726 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
TWISTNBQ3B726 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
TWISTNBQ3B726 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
TWISTNBQ3B726 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
TWISTNBQ3B726 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
TWISTNBQ3B726 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
TWISTNBQ3B726 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
TWISTNBQ3B726 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
TWISTNBQ3B726 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
TWISTNBQ3B726 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
TWISTNBQ3B726 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
TWISTNBQ3B726 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TWISTNBQ3B726 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TWISTNBQ3B726 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TWISTNBQ3B726 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TWISTNBQ3B726 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TWISTNBQ3B726 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TWISTNBQ3B726 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TWISTNBQ3B726 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TWISTNBQ3B726 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TWISTNBQ3B726 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TWISTNBQ3B726 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TWISTNBQ3B726 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TWISTNBQ3B726 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TWISTNBQ3B726 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
TWISTNBQ3B726 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TWISTNBQ3B726 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TWISTNBQ3B726 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
TWISTNBQ3B726 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
TWISTNBQ3B726 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TWISTNBQ3B726 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TWISTNBQ3B726 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
TWISTNBQ3B726 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TWISTNBQ3B726 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
TWISTNBQ3B726 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TWISTNBQ3B726 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TWISTNBQ3B726 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TWISTNBQ3B726 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TWISTNBQ3B726 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
TWISTNBQ3B726 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TWISTNBQ3B726 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
TWISTNBQ3B726 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TWISTNBQ3B726 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TWISTNBQ3B726 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TWISTNBQ3B726 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TWISTNBQ3B726 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms