Protein–RNA interactions for Protein: Q32NC0

C18orf21, UPF0711 protein C18orf21, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C18orf21Q32NC0 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
C18orf21Q32NC0 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
C18orf21Q32NC0 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
C18orf21Q32NC0 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
C18orf21Q32NC0 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
C18orf21Q32NC0 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
C18orf21Q32NC0 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
C18orf21Q32NC0 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
C18orf21Q32NC0 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
C18orf21Q32NC0 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
C18orf21Q32NC0 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
C18orf21Q32NC0 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
C18orf21Q32NC0 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
C18orf21Q32NC0 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
C18orf21Q32NC0 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
C18orf21Q32NC0 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
C18orf21Q32NC0 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
C18orf21Q32NC0 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
C18orf21Q32NC0 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
C18orf21Q32NC0 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
C18orf21Q32NC0 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
C18orf21Q32NC0 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
C18orf21Q32NC0 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
C18orf21Q32NC0 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
C18orf21Q32NC0 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
C18orf21Q32NC0 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
C18orf21Q32NC0 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
C18orf21Q32NC0 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
C18orf21Q32NC0 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
C18orf21Q32NC0 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
C18orf21Q32NC0 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
C18orf21Q32NC0 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
C18orf21Q32NC0 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
C18orf21Q32NC0 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
C18orf21Q32NC0 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
C18orf21Q32NC0 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
C18orf21Q32NC0 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
C18orf21Q32NC0 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
C18orf21Q32NC0 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
C18orf21Q32NC0 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
C18orf21Q32NC0 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
C18orf21Q32NC0 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
C18orf21Q32NC0 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
C18orf21Q32NC0 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
C18orf21Q32NC0 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
C18orf21Q32NC0 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
C18orf21Q32NC0 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
C18orf21Q32NC0 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
C18orf21Q32NC0 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
C18orf21Q32NC0 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
C18orf21Q32NC0 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
C18orf21Q32NC0 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
C18orf21Q32NC0 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
C18orf21Q32NC0 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
C18orf21Q32NC0 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
C18orf21Q32NC0 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
C18orf21Q32NC0 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
C18orf21Q32NC0 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
C18orf21Q32NC0 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
C18orf21Q32NC0 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
C18orf21Q32NC0 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
C18orf21Q32NC0 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
C18orf21Q32NC0 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
C18orf21Q32NC0 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
C18orf21Q32NC0 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
C18orf21Q32NC0 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
C18orf21Q32NC0 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
C18orf21Q32NC0 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
C18orf21Q32NC0 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
C18orf21Q32NC0 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
C18orf21Q32NC0 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
C18orf21Q32NC0 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
C18orf21Q32NC0 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
C18orf21Q32NC0 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC18.17■□□□□ 0.5
C18orf21Q32NC0 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
C18orf21Q32NC0 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
C18orf21Q32NC0 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
C18orf21Q32NC0 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
C18orf21Q32NC0 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
C18orf21Q32NC0 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
C18orf21Q32NC0 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
C18orf21Q32NC0 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC18.17■□□□□ 0.5
C18orf21Q32NC0 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
C18orf21Q32NC0 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
C18orf21Q32NC0 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
C18orf21Q32NC0 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
C18orf21Q32NC0 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
C18orf21Q32NC0 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
C18orf21Q32NC0 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
C18orf21Q32NC0 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
C18orf21Q32NC0 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
C18orf21Q32NC0 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
C18orf21Q32NC0 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
C18orf21Q32NC0 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
C18orf21Q32NC0 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
C18orf21Q32NC0 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
C18orf21Q32NC0 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
C18orf21Q32NC0 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
C18orf21Q32NC0 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
C18orf21Q32NC0 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms