Protein–RNA interactions for Protein: Q2WEN9

CEACAM16, Carcinoembryonic antigen-related cell adhesion molecule 16, humanhuman

Predictions only

Length 425 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEACAM16Q2WEN9 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CEACAM16Q2WEN9 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CEACAM16Q2WEN9 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
CEACAM16Q2WEN9 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CEACAM16Q2WEN9 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CEACAM16Q2WEN9 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CEACAM16Q2WEN9 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CEACAM16Q2WEN9 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CEACAM16Q2WEN9 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CEACAM16Q2WEN9 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CEACAM16Q2WEN9 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CEACAM16Q2WEN9 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CEACAM16Q2WEN9 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CEACAM16Q2WEN9 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CEACAM16Q2WEN9 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CEACAM16Q2WEN9 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CEACAM16Q2WEN9 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CEACAM16Q2WEN9 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CEACAM16Q2WEN9 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CEACAM16Q2WEN9 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CEACAM16Q2WEN9 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CEACAM16Q2WEN9 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CEACAM16Q2WEN9 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CEACAM16Q2WEN9 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CEACAM16Q2WEN9 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CEACAM16Q2WEN9 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CEACAM16Q2WEN9 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CEACAM16Q2WEN9 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CEACAM16Q2WEN9 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CEACAM16Q2WEN9 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CEACAM16Q2WEN9 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CEACAM16Q2WEN9 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CEACAM16Q2WEN9 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CEACAM16Q2WEN9 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CEACAM16Q2WEN9 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CEACAM16Q2WEN9 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CEACAM16Q2WEN9 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CEACAM16Q2WEN9 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CEACAM16Q2WEN9 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CEACAM16Q2WEN9 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CEACAM16Q2WEN9 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
CEACAM16Q2WEN9 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CEACAM16Q2WEN9 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CEACAM16Q2WEN9 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CEACAM16Q2WEN9 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CEACAM16Q2WEN9 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CEACAM16Q2WEN9 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CEACAM16Q2WEN9 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CEACAM16Q2WEN9 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CEACAM16Q2WEN9 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CEACAM16Q2WEN9 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CEACAM16Q2WEN9 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CEACAM16Q2WEN9 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
CEACAM16Q2WEN9 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
CEACAM16Q2WEN9 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CEACAM16Q2WEN9 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CEACAM16Q2WEN9 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CEACAM16Q2WEN9 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CEACAM16Q2WEN9 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CEACAM16Q2WEN9 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CEACAM16Q2WEN9 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CEACAM16Q2WEN9 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CEACAM16Q2WEN9 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CEACAM16Q2WEN9 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CEACAM16Q2WEN9 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CEACAM16Q2WEN9 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CEACAM16Q2WEN9 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CEACAM16Q2WEN9 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CEACAM16Q2WEN9 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CEACAM16Q2WEN9 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CEACAM16Q2WEN9 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CEACAM16Q2WEN9 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CEACAM16Q2WEN9 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CEACAM16Q2WEN9 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CEACAM16Q2WEN9 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CEACAM16Q2WEN9 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CEACAM16Q2WEN9 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CEACAM16Q2WEN9 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CEACAM16Q2WEN9 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CEACAM16Q2WEN9 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CEACAM16Q2WEN9 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CEACAM16Q2WEN9 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CEACAM16Q2WEN9 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
CEACAM16Q2WEN9 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CEACAM16Q2WEN9 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CEACAM16Q2WEN9 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CEACAM16Q2WEN9 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CEACAM16Q2WEN9 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CEACAM16Q2WEN9 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CEACAM16Q2WEN9 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CEACAM16Q2WEN9 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CEACAM16Q2WEN9 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CEACAM16Q2WEN9 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CEACAM16Q2WEN9 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CEACAM16Q2WEN9 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CEACAM16Q2WEN9 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CEACAM16Q2WEN9 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CEACAM16Q2WEN9 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CEACAM16Q2WEN9 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CEACAM16Q2WEN9 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.8 ms