Protein–RNA interactions for Protein: Q2V2M9

FHOD3, FH1/FH2 domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,422 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FHOD3Q2V2M9 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
FHOD3Q2V2M9 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.34■■■□□ 2.29
FHOD3Q2V2M9 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
FHOD3Q2V2M9 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
FHOD3Q2V2M9 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
FHOD3Q2V2M9 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
FHOD3Q2V2M9 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
FHOD3Q2V2M9 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC29.34■■■□□ 2.29
FHOD3Q2V2M9 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
FHOD3Q2V2M9 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
FHOD3Q2V2M9 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
FHOD3Q2V2M9 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
FHOD3Q2V2M9 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
FHOD3Q2V2M9 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
FHOD3Q2V2M9 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
FHOD3Q2V2M9 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC29.33■■■□□ 2.29
FHOD3Q2V2M9 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
FHOD3Q2V2M9 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC29.33■■■□□ 2.29
FHOD3Q2V2M9 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.33■■■□□ 2.29
FHOD3Q2V2M9 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC29.33■■■□□ 2.29
FHOD3Q2V2M9 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC29.33■■■□□ 2.29
FHOD3Q2V2M9 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
FHOD3Q2V2M9 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
FHOD3Q2V2M9 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
FHOD3Q2V2M9 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
FHOD3Q2V2M9 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
FHOD3Q2V2M9 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
FHOD3Q2V2M9 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
FHOD3Q2V2M9 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
FHOD3Q2V2M9 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
FHOD3Q2V2M9 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
FHOD3Q2V2M9 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
FHOD3Q2V2M9 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.32■■■□□ 2.28
FHOD3Q2V2M9 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
FHOD3Q2V2M9 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC29.32■■■□□ 2.28
FHOD3Q2V2M9 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC29.32■■■□□ 2.28
FHOD3Q2V2M9 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
FHOD3Q2V2M9 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
FHOD3Q2V2M9 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
FHOD3Q2V2M9 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
FHOD3Q2V2M9 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
FHOD3Q2V2M9 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
FHOD3Q2V2M9 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
FHOD3Q2V2M9 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
FHOD3Q2V2M9 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
FHOD3Q2V2M9 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
FHOD3Q2V2M9 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
FHOD3Q2V2M9 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
FHOD3Q2V2M9 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
FHOD3Q2V2M9 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
FHOD3Q2V2M9 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
FHOD3Q2V2M9 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
FHOD3Q2V2M9 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
FHOD3Q2V2M9 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
FHOD3Q2V2M9 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
FHOD3Q2V2M9 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
FHOD3Q2V2M9 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
FHOD3Q2V2M9 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
FHOD3Q2V2M9 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
FHOD3Q2V2M9 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
FHOD3Q2V2M9 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
FHOD3Q2V2M9 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
FHOD3Q2V2M9 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
FHOD3Q2V2M9 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
FHOD3Q2V2M9 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
FHOD3Q2V2M9 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
FHOD3Q2V2M9 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
FHOD3Q2V2M9 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
FHOD3Q2V2M9 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
FHOD3Q2V2M9 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
FHOD3Q2V2M9 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC29.3■■■□□ 2.28
FHOD3Q2V2M9 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
FHOD3Q2V2M9 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
FHOD3Q2V2M9 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
FHOD3Q2V2M9 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
FHOD3Q2V2M9 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
FHOD3Q2V2M9 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
FHOD3Q2V2M9 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
FHOD3Q2V2M9 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
FHOD3Q2V2M9 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC29.29■■■□□ 2.28
FHOD3Q2V2M9 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
FHOD3Q2V2M9 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
FHOD3Q2V2M9 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
FHOD3Q2V2M9 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
FHOD3Q2V2M9 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
FHOD3Q2V2M9 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
FHOD3Q2V2M9 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
FHOD3Q2V2M9 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
FHOD3Q2V2M9 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
FHOD3Q2V2M9 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
FHOD3Q2V2M9 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
FHOD3Q2V2M9 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
FHOD3Q2V2M9 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
FHOD3Q2V2M9 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
FHOD3Q2V2M9 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
FHOD3Q2V2M9 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
FHOD3Q2V2M9 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
FHOD3Q2V2M9 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
FHOD3Q2V2M9 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
FHOD3Q2V2M9 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.5 ms