Protein–RNA interactions for Protein: Q2TAC2

CCDC57, Coiled-coil domain-containing protein 57, humanhuman

Predictions only

Length 916 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC57Q2TAC2 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC57Q2TAC2 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC57Q2TAC2 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC57Q2TAC2 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC57Q2TAC2 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC57Q2TAC2 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC57Q2TAC2 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC57Q2TAC2 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC57Q2TAC2 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC57Q2TAC2 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC57Q2TAC2 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC57Q2TAC2 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC57Q2TAC2 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC57Q2TAC2 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC57Q2TAC2 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC57Q2TAC2 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC57Q2TAC2 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC57Q2TAC2 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC57Q2TAC2 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC57Q2TAC2 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC57Q2TAC2 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC57Q2TAC2 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC57Q2TAC2 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC57Q2TAC2 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC57Q2TAC2 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC57Q2TAC2 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC57Q2TAC2 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.27
CCDC57Q2TAC2 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC57Q2TAC2 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC57Q2TAC2 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC57Q2TAC2 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC57Q2TAC2 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC57Q2TAC2 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC57Q2TAC2 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC57Q2TAC2 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC57Q2TAC2 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC57Q2TAC2 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC57Q2TAC2 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC57Q2TAC2 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC57Q2TAC2 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC57Q2TAC2 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC57Q2TAC2 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC57Q2TAC2 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC57Q2TAC2 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC57Q2TAC2 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC57Q2TAC2 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC57Q2TAC2 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC57Q2TAC2 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC57Q2TAC2 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC57Q2TAC2 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC57Q2TAC2 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC57Q2TAC2 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC57Q2TAC2 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC57Q2TAC2 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC57Q2TAC2 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC57Q2TAC2 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC57Q2TAC2 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC57Q2TAC2 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC57Q2TAC2 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC57Q2TAC2 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC57Q2TAC2 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC57Q2TAC2 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC57Q2TAC2 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC57Q2TAC2 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC57Q2TAC2 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC57Q2TAC2 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC57Q2TAC2 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC57Q2TAC2 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC57Q2TAC2 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC57Q2TAC2 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC57Q2TAC2 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC57Q2TAC2 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC57Q2TAC2 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC57Q2TAC2 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC57Q2TAC2 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC57Q2TAC2 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC57Q2TAC2 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC57Q2TAC2 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC57Q2TAC2 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC57Q2TAC2 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC57Q2TAC2 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC57Q2TAC2 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC57Q2TAC2 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC57Q2TAC2 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC57Q2TAC2 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC57Q2TAC2 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC57Q2TAC2 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC57Q2TAC2 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC57Q2TAC2 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC57Q2TAC2 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC57Q2TAC2 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC57Q2TAC2 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC57Q2TAC2 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC57Q2TAC2 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC57Q2TAC2 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC57Q2TAC2 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC57Q2TAC2 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC57Q2TAC2 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC57Q2TAC2 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC57Q2TAC2 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.1 ms