Protein–RNA interactions for Protein: Q16827

PTPRO, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase O, humanhuman

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Length 1,216 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPROQ16827 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
PTPROQ16827 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
PTPROQ16827 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
PTPROQ16827 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
PTPROQ16827 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
PTPROQ16827 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
PTPROQ16827 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
PTPROQ16827 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
PTPROQ16827 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
PTPROQ16827 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
PTPROQ16827 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
PTPROQ16827 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
PTPROQ16827 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
PTPROQ16827 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
PTPROQ16827 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
PTPROQ16827 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
PTPROQ16827 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
PTPROQ16827 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
PTPROQ16827 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PTPROQ16827 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PTPROQ16827 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PTPROQ16827 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PTPROQ16827 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PTPROQ16827 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PTPROQ16827 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PTPROQ16827 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PTPROQ16827 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PTPROQ16827 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PTPROQ16827 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PTPROQ16827 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PTPROQ16827 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PTPROQ16827 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PTPROQ16827 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PTPROQ16827 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PTPROQ16827 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PTPROQ16827 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PTPROQ16827 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PTPROQ16827 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PTPROQ16827 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PTPROQ16827 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PTPROQ16827 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PTPROQ16827 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PTPROQ16827 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PTPROQ16827 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PTPROQ16827 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PTPROQ16827 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PTPROQ16827 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PTPROQ16827 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
PTPROQ16827 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PTPROQ16827 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PTPROQ16827 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PTPROQ16827 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PTPROQ16827 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PTPROQ16827 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PTPROQ16827 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PTPROQ16827 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PTPROQ16827 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
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PTPROQ16827 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
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PTPROQ16827 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PTPROQ16827 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PTPROQ16827 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PTPROQ16827 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
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PTPROQ16827 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PTPROQ16827 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PTPROQ16827 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PTPROQ16827 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PTPROQ16827 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PTPROQ16827 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PTPROQ16827 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PTPROQ16827 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PTPROQ16827 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PTPROQ16827 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PTPROQ16827 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PTPROQ16827 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PTPROQ16827 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
PTPROQ16827 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PTPROQ16827 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PTPROQ16827 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PTPROQ16827 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PTPROQ16827 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PTPROQ16827 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PTPROQ16827 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PTPROQ16827 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PTPROQ16827 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PTPROQ16827 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PTPROQ16827 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
PTPROQ16827 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PTPROQ16827 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PTPROQ16827 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PTPROQ16827 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PTPROQ16827 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PTPROQ16827 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PTPROQ16827 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
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