Protein–RNA interactions for Protein: Q16533

SNAPC1, snRNA-activating protein complex subunit 1, humanhuman

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Length 368 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAPC1Q16533 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SNAPC1Q16533 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SNAPC1Q16533 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SNAPC1Q16533 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SNAPC1Q16533 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SNAPC1Q16533 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SNAPC1Q16533 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SNAPC1Q16533 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SNAPC1Q16533 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SNAPC1Q16533 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SNAPC1Q16533 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SNAPC1Q16533 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SNAPC1Q16533 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SNAPC1Q16533 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SNAPC1Q16533 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SNAPC1Q16533 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SNAPC1Q16533 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SNAPC1Q16533 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SNAPC1Q16533 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SNAPC1Q16533 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SNAPC1Q16533 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SNAPC1Q16533 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
SNAPC1Q16533 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SNAPC1Q16533 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SNAPC1Q16533 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SNAPC1Q16533 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC17■□□□□ 0.31
SNAPC1Q16533 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SNAPC1Q16533 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SNAPC1Q16533 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SNAPC1Q16533 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SNAPC1Q16533 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SNAPC1Q16533 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SNAPC1Q16533 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SNAPC1Q16533 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SNAPC1Q16533 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
SNAPC1Q16533 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SNAPC1Q16533 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
SNAPC1Q16533 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SNAPC1Q16533 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SNAPC1Q16533 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SNAPC1Q16533 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SNAPC1Q16533 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SNAPC1Q16533 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SNAPC1Q16533 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SNAPC1Q16533 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SNAPC1Q16533 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SNAPC1Q16533 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SNAPC1Q16533 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SNAPC1Q16533 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SNAPC1Q16533 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SNAPC1Q16533 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SNAPC1Q16533 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SNAPC1Q16533 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SNAPC1Q16533 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SNAPC1Q16533 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SNAPC1Q16533 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SNAPC1Q16533 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SNAPC1Q16533 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SNAPC1Q16533 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SNAPC1Q16533 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SNAPC1Q16533 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SNAPC1Q16533 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SNAPC1Q16533 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SNAPC1Q16533 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SNAPC1Q16533 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SNAPC1Q16533 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SNAPC1Q16533 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SNAPC1Q16533 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SNAPC1Q16533 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SNAPC1Q16533 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SNAPC1Q16533 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SNAPC1Q16533 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SNAPC1Q16533 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SNAPC1Q16533 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SNAPC1Q16533 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SNAPC1Q16533 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
SNAPC1Q16533 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SNAPC1Q16533 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
SNAPC1Q16533 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SNAPC1Q16533 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SNAPC1Q16533 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
SNAPC1Q16533 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SNAPC1Q16533 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SNAPC1Q16533 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SNAPC1Q16533 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SNAPC1Q16533 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SNAPC1Q16533 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SNAPC1Q16533 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
SNAPC1Q16533 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SNAPC1Q16533 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SNAPC1Q16533 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SNAPC1Q16533 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SNAPC1Q16533 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SNAPC1Q16533 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SNAPC1Q16533 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SNAPC1Q16533 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SNAPC1Q16533 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SNAPC1Q16533 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SNAPC1Q16533 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
SNAPC1Q16533 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
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