Protein–RNA interactions for Protein: Q16363

LAMA4, Laminin subunit alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,823 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMA4Q16363 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
LAMA4Q16363 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
LAMA4Q16363 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
LAMA4Q16363 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
LAMA4Q16363 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
LAMA4Q16363 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
LAMA4Q16363 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
LAMA4Q16363 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
LAMA4Q16363 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
LAMA4Q16363 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
LAMA4Q16363 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
LAMA4Q16363 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
LAMA4Q16363 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
LAMA4Q16363 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
LAMA4Q16363 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
LAMA4Q16363 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
LAMA4Q16363 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
LAMA4Q16363 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
LAMA4Q16363 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
LAMA4Q16363 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
LAMA4Q16363 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
LAMA4Q16363 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
LAMA4Q16363 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
LAMA4Q16363 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
LAMA4Q16363 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
LAMA4Q16363 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
LAMA4Q16363 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
LAMA4Q16363 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
LAMA4Q16363 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
LAMA4Q16363 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
LAMA4Q16363 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
LAMA4Q16363 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
LAMA4Q16363 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
LAMA4Q16363 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
LAMA4Q16363 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
LAMA4Q16363 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
LAMA4Q16363 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
LAMA4Q16363 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
LAMA4Q16363 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
LAMA4Q16363 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC21.95■■□□□ 1.1
LAMA4Q16363 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
LAMA4Q16363 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
LAMA4Q16363 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
LAMA4Q16363 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
LAMA4Q16363 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
LAMA4Q16363 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
LAMA4Q16363 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
LAMA4Q16363 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
LAMA4Q16363 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
LAMA4Q16363 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
LAMA4Q16363 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
LAMA4Q16363 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
LAMA4Q16363 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
LAMA4Q16363 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC21.94■■□□□ 1.1
LAMA4Q16363 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
LAMA4Q16363 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
LAMA4Q16363 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
LAMA4Q16363 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
LAMA4Q16363 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
LAMA4Q16363 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
LAMA4Q16363 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
LAMA4Q16363 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
LAMA4Q16363 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
LAMA4Q16363 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
LAMA4Q16363 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
LAMA4Q16363 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
LAMA4Q16363 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
LAMA4Q16363 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
LAMA4Q16363 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.94■■□□□ 1.1
LAMA4Q16363 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
LAMA4Q16363 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
LAMA4Q16363 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
LAMA4Q16363 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC21.94■■□□□ 1.1
LAMA4Q16363 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
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LAMA4Q16363 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
LAMA4Q16363 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
LAMA4Q16363 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
LAMA4Q16363 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
LAMA4Q16363 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
LAMA4Q16363 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
LAMA4Q16363 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
LAMA4Q16363 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC21.93■■□□□ 1.1
LAMA4Q16363 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.93■■□□□ 1.1
LAMA4Q16363 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
LAMA4Q16363 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
LAMA4Q16363 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
LAMA4Q16363 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
LAMA4Q16363 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
LAMA4Q16363 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
LAMA4Q16363 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
LAMA4Q16363 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
LAMA4Q16363 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
LAMA4Q16363 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
LAMA4Q16363 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
LAMA4Q16363 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
LAMA4Q16363 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
LAMA4Q16363 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
LAMA4Q16363 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
LAMA4Q16363 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
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