Protein–RNA interactions for Protein: Q16204

CCDC6, Coiled-coil domain-containing protein 6, humanhuman

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Length 474 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC6Q16204 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
CCDC6Q16204 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
CCDC6Q16204 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
CCDC6Q16204 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.45■□□□□ 0.7
CCDC6Q16204 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
CCDC6Q16204 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
CCDC6Q16204 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
CCDC6Q16204 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
CCDC6Q16204 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
CCDC6Q16204 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
CCDC6Q16204 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
CCDC6Q16204 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
CCDC6Q16204 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
CCDC6Q16204 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
CCDC6Q16204 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
CCDC6Q16204 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
CCDC6Q16204 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
CCDC6Q16204 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
CCDC6Q16204 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
CCDC6Q16204 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
CCDC6Q16204 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC19.44■□□□□ 0.7
CCDC6Q16204 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC19.44■□□□□ 0.7
CCDC6Q16204 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
CCDC6Q16204 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
CCDC6Q16204 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC19.44■□□□□ 0.7
CCDC6Q16204 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
CCDC6Q16204 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
CCDC6Q16204 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.44■□□□□ 0.7
CCDC6Q16204 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
CCDC6Q16204 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
CCDC6Q16204 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC19.44■□□□□ 0.7
CCDC6Q16204 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
CCDC6Q16204 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
CCDC6Q16204 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
CCDC6Q16204 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
CCDC6Q16204 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
CCDC6Q16204 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
CCDC6Q16204 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC19.44■□□□□ 0.7
CCDC6Q16204 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
CCDC6Q16204 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC19.44■□□□□ 0.7
CCDC6Q16204 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
CCDC6Q16204 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC19.44■□□□□ 0.7
CCDC6Q16204 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
CCDC6Q16204 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
CCDC6Q16204 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
CCDC6Q16204 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
CCDC6Q16204 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
CCDC6Q16204 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
CCDC6Q16204 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
CCDC6Q16204 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
CCDC6Q16204 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
CCDC6Q16204 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
CCDC6Q16204 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
CCDC6Q16204 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC19.43■□□□□ 0.7
CCDC6Q16204 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
CCDC6Q16204 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.43■□□□□ 0.7
CCDC6Q16204 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
CCDC6Q16204 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
CCDC6Q16204 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
CCDC6Q16204 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
CCDC6Q16204 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
CCDC6Q16204 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
CCDC6Q16204 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
CCDC6Q16204 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
CCDC6Q16204 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
CCDC6Q16204 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
CCDC6Q16204 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC19.43■□□□□ 0.7
CCDC6Q16204 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
CCDC6Q16204 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
CCDC6Q16204 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
CCDC6Q16204 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
CCDC6Q16204 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
CCDC6Q16204 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
CCDC6Q16204 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
CCDC6Q16204 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
CCDC6Q16204 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
CCDC6Q16204 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
CCDC6Q16204 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
CCDC6Q16204 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
CCDC6Q16204 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.43■□□□□ 0.7
CCDC6Q16204 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
CCDC6Q16204 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
CCDC6Q16204 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
CCDC6Q16204 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
CCDC6Q16204 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
CCDC6Q16204 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
CCDC6Q16204 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
CCDC6Q16204 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
CCDC6Q16204 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
CCDC6Q16204 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
CCDC6Q16204 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
CCDC6Q16204 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
CCDC6Q16204 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
CCDC6Q16204 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
CCDC6Q16204 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
CCDC6Q16204 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
CCDC6Q16204 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
CCDC6Q16204 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC19.42■□□□□ 0.7
CCDC6Q16204 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
CCDC6Q16204 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
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