Protein–RNA interactions for Protein: Q15904

ATP6AP1, V-type proton ATPase subunit S1, humanhuman

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Length 470 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP6AP1Q15904 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ATP6AP1Q15904 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ATP6AP1Q15904 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ATP6AP1Q15904 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ATP6AP1Q15904 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ATP6AP1Q15904 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ATP6AP1Q15904 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ATP6AP1Q15904 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ATP6AP1Q15904 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ATP6AP1Q15904 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ATP6AP1Q15904 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ATP6AP1Q15904 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
ATP6AP1Q15904 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ATP6AP1Q15904 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ATP6AP1Q15904 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ATP6AP1Q15904 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ATP6AP1Q15904 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ATP6AP1Q15904 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ATP6AP1Q15904 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ATP6AP1Q15904 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
ATP6AP1Q15904 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ATP6AP1Q15904 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ATP6AP1Q15904 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ATP6AP1Q15904 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ATP6AP1Q15904 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
ATP6AP1Q15904 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ATP6AP1Q15904 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ATP6AP1Q15904 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ATP6AP1Q15904 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ATP6AP1Q15904 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ATP6AP1Q15904 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ATP6AP1Q15904 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ATP6AP1Q15904 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ATP6AP1Q15904 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ATP6AP1Q15904 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ATP6AP1Q15904 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ATP6AP1Q15904 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ATP6AP1Q15904 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ATP6AP1Q15904 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ATP6AP1Q15904 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ATP6AP1Q15904 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ATP6AP1Q15904 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ATP6AP1Q15904 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ATP6AP1Q15904 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ATP6AP1Q15904 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ATP6AP1Q15904 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ATP6AP1Q15904 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ATP6AP1Q15904 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ATP6AP1Q15904 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ATP6AP1Q15904 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ATP6AP1Q15904 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ATP6AP1Q15904 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ATP6AP1Q15904 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ATP6AP1Q15904 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ATP6AP1Q15904 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ATP6AP1Q15904 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ATP6AP1Q15904 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ATP6AP1Q15904 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
ATP6AP1Q15904 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ATP6AP1Q15904 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ATP6AP1Q15904 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ATP6AP1Q15904 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ATP6AP1Q15904 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ATP6AP1Q15904 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
ATP6AP1Q15904 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ATP6AP1Q15904 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ATP6AP1Q15904 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ATP6AP1Q15904 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ATP6AP1Q15904 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ATP6AP1Q15904 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ATP6AP1Q15904 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ATP6AP1Q15904 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ATP6AP1Q15904 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ATP6AP1Q15904 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ATP6AP1Q15904 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ATP6AP1Q15904 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ATP6AP1Q15904 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ATP6AP1Q15904 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ATP6AP1Q15904 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ATP6AP1Q15904 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ATP6AP1Q15904 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ATP6AP1Q15904 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ATP6AP1Q15904 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ATP6AP1Q15904 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
ATP6AP1Q15904 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ATP6AP1Q15904 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ATP6AP1Q15904 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ATP6AP1Q15904 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ATP6AP1Q15904 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ATP6AP1Q15904 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ATP6AP1Q15904 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ATP6AP1Q15904 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ATP6AP1Q15904 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ATP6AP1Q15904 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ATP6AP1Q15904 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ATP6AP1Q15904 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ATP6AP1Q15904 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ATP6AP1Q15904 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ATP6AP1Q15904 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ATP6AP1Q15904 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
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