Protein–RNA interactions for Protein: Q15843

NEDD8, NEDD8, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8Q15843 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
NEDD8Q15843 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
NEDD8Q15843 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
NEDD8Q15843 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC17.07■□□□□ 0.32
NEDD8Q15843 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NEDD8Q15843 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NEDD8Q15843 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NEDD8Q15843 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NEDD8Q15843 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
NEDD8Q15843 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
NEDD8Q15843 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NEDD8Q15843 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
NEDD8Q15843 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
NEDD8Q15843 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NEDD8Q15843 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NEDD8Q15843 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NEDD8Q15843 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
NEDD8Q15843 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
NEDD8Q15843 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
NEDD8Q15843 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NEDD8Q15843 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NEDD8Q15843 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NEDD8Q15843 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NEDD8Q15843 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NEDD8Q15843 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NEDD8Q15843 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NEDD8Q15843 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
NEDD8Q15843 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
NEDD8Q15843 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NEDD8Q15843 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
NEDD8Q15843 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
NEDD8Q15843 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NEDD8Q15843 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
NEDD8Q15843 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
NEDD8Q15843 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
NEDD8Q15843 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NEDD8Q15843 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NEDD8Q15843 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NEDD8Q15843 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NEDD8Q15843 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NEDD8Q15843 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NEDD8Q15843 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
NEDD8Q15843 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
NEDD8Q15843 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
NEDD8Q15843 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
NEDD8Q15843 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
NEDD8Q15843 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
NEDD8Q15843 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
NEDD8Q15843 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
NEDD8Q15843 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
NEDD8Q15843 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
NEDD8Q15843 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
NEDD8Q15843 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
NEDD8Q15843 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
NEDD8Q15843 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC17.05■□□□□ 0.32
NEDD8Q15843 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC17.05■□□□□ 0.32
NEDD8Q15843 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
NEDD8Q15843 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
NEDD8Q15843 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
NEDD8Q15843 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
NEDD8Q15843 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
NEDD8Q15843 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
NEDD8Q15843 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
NEDD8Q15843 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
NEDD8Q15843 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
NEDD8Q15843 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
NEDD8Q15843 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
NEDD8Q15843 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
NEDD8Q15843 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
NEDD8Q15843 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
NEDD8Q15843 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
NEDD8Q15843 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
NEDD8Q15843 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
NEDD8Q15843 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
NEDD8Q15843 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
NEDD8Q15843 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
NEDD8Q15843 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
NEDD8Q15843 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
NEDD8Q15843 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
NEDD8Q15843 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
NEDD8Q15843 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
NEDD8Q15843 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
NEDD8Q15843 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
NEDD8Q15843 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
NEDD8Q15843 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
NEDD8Q15843 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
NEDD8Q15843 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
NEDD8Q15843 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
NEDD8Q15843 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
NEDD8Q15843 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
NEDD8Q15843 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
NEDD8Q15843 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
NEDD8Q15843 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
NEDD8Q15843 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
NEDD8Q15843 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
NEDD8Q15843 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
NEDD8Q15843 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
NEDD8Q15843 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
NEDD8Q15843 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
NEDD8Q15843 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
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