Protein–RNA interactions for Protein: Q15431

SYCP1, Synaptonemal complex protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 976 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP1Q15431 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
SYCP1Q15431 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SYCP1Q15431 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SYCP1Q15431 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SYCP1Q15431 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
SYCP1Q15431 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
SYCP1Q15431 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC20.73■□□□□ 0.91
SYCP1Q15431 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
SYCP1Q15431 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SYCP1Q15431 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
SYCP1Q15431 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SYCP1Q15431 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
SYCP1Q15431 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
SYCP1Q15431 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
SYCP1Q15431 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SYCP1Q15431 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
SYCP1Q15431 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
SYCP1Q15431 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
SYCP1Q15431 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SYCP1Q15431 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SYCP1Q15431 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
SYCP1Q15431 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
SYCP1Q15431 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
SYCP1Q15431 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
SYCP1Q15431 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SYCP1Q15431 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SYCP1Q15431 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SYCP1Q15431 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SYCP1Q15431 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SYCP1Q15431 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SYCP1Q15431 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SYCP1Q15431 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
SYCP1Q15431 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
SYCP1Q15431 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
SYCP1Q15431 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
SYCP1Q15431 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC20.72■□□□□ 0.91
SYCP1Q15431 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SYCP1Q15431 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
SYCP1Q15431 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SYCP1Q15431 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SYCP1Q15431 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SYCP1Q15431 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
SYCP1Q15431 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
SYCP1Q15431 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
SYCP1Q15431 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SYCP1Q15431 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
SYCP1Q15431 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
SYCP1Q15431 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
SYCP1Q15431 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SYCP1Q15431 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.71■□□□□ 0.91
SYCP1Q15431 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SYCP1Q15431 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SYCP1Q15431 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SYCP1Q15431 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SYCP1Q15431 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SYCP1Q15431 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
SYCP1Q15431 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SYCP1Q15431 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
SYCP1Q15431 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SYCP1Q15431 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
SYCP1Q15431 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC20.71■□□□□ 0.91
SYCP1Q15431 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
SYCP1Q15431 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SYCP1Q15431 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
SYCP1Q15431 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
SYCP1Q15431 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SYCP1Q15431 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
SYCP1Q15431 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
SYCP1Q15431 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SYCP1Q15431 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SYCP1Q15431 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
SYCP1Q15431 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SYCP1Q15431 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.91
SYCP1Q15431 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.91
SYCP1Q15431 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.91
SYCP1Q15431 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.91
SYCP1Q15431 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
SYCP1Q15431 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
SYCP1Q15431 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
SYCP1Q15431 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
SYCP1Q15431 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
SYCP1Q15431 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
SYCP1Q15431 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
SYCP1Q15431 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
SYCP1Q15431 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
SYCP1Q15431 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
SYCP1Q15431 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
SYCP1Q15431 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
SYCP1Q15431 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC20.7■□□□□ 0.9
SYCP1Q15431 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC20.7■□□□□ 0.9
SYCP1Q15431 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
SYCP1Q15431 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
SYCP1Q15431 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
SYCP1Q15431 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
SYCP1Q15431 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
SYCP1Q15431 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
SYCP1Q15431 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC20.7■□□□□ 0.9
SYCP1Q15431 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
SYCP1Q15431 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
SYCP1Q15431 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.3 ms