Protein–RNA interactions for Protein: Q15413

RYR3, Ryanodine receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 4,870 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RYR3Q15413 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
RYR3Q15413 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
RYR3Q15413 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
RYR3Q15413 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
RYR3Q15413 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
RYR3Q15413 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
RYR3Q15413 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
RYR3Q15413 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
RYR3Q15413 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
RYR3Q15413 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
RYR3Q15413 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
RYR3Q15413 WDR45-208ENST00000396681 1146 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
RYR3Q15413 STMN1-204ENST00000426559 948 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
RYR3Q15413 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
RYR3Q15413 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
RYR3Q15413 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
RYR3Q15413 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
RYR3Q15413 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
RYR3Q15413 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
RYR3Q15413 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
RYR3Q15413 DMKN-204ENST00000408915 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
RYR3Q15413 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
RYR3Q15413 GNG4-205ENST00000484517 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
RYR3Q15413 NAT9-224ENST00000583757 583 ntTSL 3 BASIC12.45□□□□□ -0.42
RYR3Q15413 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
RYR3Q15413 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
RYR3Q15413 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
RYR3Q15413 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
RYR3Q15413 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
RYR3Q15413 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
RYR3Q15413 RPL28-206ENST00000558752 671 ntTSL 3 BASIC12.44□□□□□ -0.42
RYR3Q15413 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC12.44□□□□□ -0.42
RYR3Q15413 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
RYR3Q15413 GPR182-203ENST00000622922 591 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
RYR3Q15413 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
RYR3Q15413 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
RYR3Q15413 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
RYR3Q15413 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
RYR3Q15413 ZNF138-201ENST00000307355 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC12.44□□□□□ -0.42
RYR3Q15413 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
RYR3Q15413 ZFAND2B-203ENST00000409206 1159 ntTSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
RYR3Q15413 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
RYR3Q15413 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC12.44□□□□□ -0.42
RYR3Q15413 EEF1D-207ENST00000524624 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
RYR3Q15413 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
RYR3Q15413 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
RYR3Q15413 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
RYR3Q15413 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
RYR3Q15413 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
RYR3Q15413 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
RYR3Q15413 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC12.44□□□□□ -0.42
RYR3Q15413 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
RYR3Q15413 AP001995.1-201ENST00000531784 1157 ntTSL 4 BASIC12.44□□□□□ -0.42
RYR3Q15413 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
RYR3Q15413 AC126696.2-201ENST00000563687 522 ntTSL 3 BASIC12.44□□□□□ -0.42
RYR3Q15413 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
RYR3Q15413 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
RYR3Q15413 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
RYR3Q15413 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
RYR3Q15413 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
RYR3Q15413 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
RYR3Q15413 IFITM3-201ENST00000399808 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
RYR3Q15413 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
RYR3Q15413 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.44□□□□□ -0.42
RYR3Q15413 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC12.44□□□□□ -0.42
RYR3Q15413 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
RYR3Q15413 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
RYR3Q15413 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
RYR3Q15413 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
RYR3Q15413 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
RYR3Q15413 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
RYR3Q15413 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
RYR3Q15413 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
RYR3Q15413 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC12.43□□□□□ -0.42
RYR3Q15413 RCAN1-212ENST00000492600 935 ntTSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
RYR3Q15413 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
RYR3Q15413 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
RYR3Q15413 BCYRN1-201ENST00000418539 200 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
RYR3Q15413 HHEX-203ENST00000492654 808 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
RYR3Q15413 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
RYR3Q15413 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
RYR3Q15413 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
RYR3Q15413 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
RYR3Q15413 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
RYR3Q15413 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
RYR3Q15413 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
RYR3Q15413 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
RYR3Q15413 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
RYR3Q15413 VCX3B-202ENST00000381032 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
RYR3Q15413 GOLGA6L11P-201ENST00000417252 1298 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
RYR3Q15413 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
RYR3Q15413 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
RYR3Q15413 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
RYR3Q15413 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
RYR3Q15413 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
RYR3Q15413 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
RYR3Q15413 VCX2-201ENST00000317103 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
RYR3Q15413 SLC18B1-202ENST00000367918 472 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
RYR3Q15413 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
RYR3Q15413 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC12.43□□□□□ -0.42
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