Protein–RNA interactions for Protein: Q15361

TTF1, Transcription termination factor 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 905 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTF1Q15361 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
TTF1Q15361 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TTF1Q15361 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TTF1Q15361 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TTF1Q15361 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TTF1Q15361 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TTF1Q15361 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TTF1Q15361 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TTF1Q15361 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TTF1Q15361 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TTF1Q15361 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TTF1Q15361 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TTF1Q15361 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TTF1Q15361 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TTF1Q15361 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TTF1Q15361 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TTF1Q15361 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TTF1Q15361 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TTF1Q15361 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TTF1Q15361 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TTF1Q15361 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TTF1Q15361 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TTF1Q15361 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
TTF1Q15361 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TTF1Q15361 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TTF1Q15361 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TTF1Q15361 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TTF1Q15361 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TTF1Q15361 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TTF1Q15361 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TTF1Q15361 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TTF1Q15361 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TTF1Q15361 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
TTF1Q15361 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TTF1Q15361 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TTF1Q15361 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TTF1Q15361 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TTF1Q15361 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TTF1Q15361 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TTF1Q15361 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TTF1Q15361 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TTF1Q15361 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TTF1Q15361 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TTF1Q15361 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TTF1Q15361 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TTF1Q15361 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TTF1Q15361 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
TTF1Q15361 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TTF1Q15361 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TTF1Q15361 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TTF1Q15361 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TTF1Q15361 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TTF1Q15361 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TTF1Q15361 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TTF1Q15361 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TTF1Q15361 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TTF1Q15361 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TTF1Q15361 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TTF1Q15361 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TTF1Q15361 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TTF1Q15361 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TTF1Q15361 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TTF1Q15361 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TTF1Q15361 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TTF1Q15361 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TTF1Q15361 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TTF1Q15361 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TTF1Q15361 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TTF1Q15361 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TTF1Q15361 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TTF1Q15361 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TTF1Q15361 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TTF1Q15361 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TTF1Q15361 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
TTF1Q15361 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TTF1Q15361 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TTF1Q15361 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
TTF1Q15361 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TTF1Q15361 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TTF1Q15361 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TTF1Q15361 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TTF1Q15361 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TTF1Q15361 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TTF1Q15361 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TTF1Q15361 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TTF1Q15361 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TTF1Q15361 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TTF1Q15361 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TTF1Q15361 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TTF1Q15361 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TTF1Q15361 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TTF1Q15361 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TTF1Q15361 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
TTF1Q15361 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TTF1Q15361 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TTF1Q15361 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TTF1Q15361 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TTF1Q15361 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TTF1Q15361 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TTF1Q15361 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
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