Protein–RNA interactions for Protein: Q15256

PTPRR, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase R, humanhuman

Predictions only

Length 657 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRRQ15256 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PTPRRQ15256 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PTPRRQ15256 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PTPRRQ15256 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PTPRRQ15256 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PTPRRQ15256 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
PTPRRQ15256 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PTPRRQ15256 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PTPRRQ15256 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PTPRRQ15256 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PTPRRQ15256 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PTPRRQ15256 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PTPRRQ15256 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
PTPRRQ15256 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PTPRRQ15256 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PTPRRQ15256 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PTPRRQ15256 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PTPRRQ15256 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PTPRRQ15256 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PTPRRQ15256 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PTPRRQ15256 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PTPRRQ15256 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PTPRRQ15256 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PTPRRQ15256 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PTPRRQ15256 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PTPRRQ15256 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PTPRRQ15256 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PTPRRQ15256 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PTPRRQ15256 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PTPRRQ15256 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PTPRRQ15256 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PTPRRQ15256 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PTPRRQ15256 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PTPRRQ15256 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PTPRRQ15256 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PTPRRQ15256 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PTPRRQ15256 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PTPRRQ15256 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PTPRRQ15256 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PTPRRQ15256 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PTPRRQ15256 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PTPRRQ15256 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
PTPRRQ15256 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PTPRRQ15256 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PTPRRQ15256 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
PTPRRQ15256 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PTPRRQ15256 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PTPRRQ15256 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PTPRRQ15256 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PTPRRQ15256 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PTPRRQ15256 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
PTPRRQ15256 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
PTPRRQ15256 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PTPRRQ15256 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PTPRRQ15256 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PTPRRQ15256 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PTPRRQ15256 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PTPRRQ15256 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PTPRRQ15256 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PTPRRQ15256 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PTPRRQ15256 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PTPRRQ15256 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PTPRRQ15256 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PTPRRQ15256 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PTPRRQ15256 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PTPRRQ15256 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
PTPRRQ15256 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PTPRRQ15256 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PTPRRQ15256 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PTPRRQ15256 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PTPRRQ15256 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PTPRRQ15256 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PTPRRQ15256 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PTPRRQ15256 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PTPRRQ15256 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PTPRRQ15256 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PTPRRQ15256 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PTPRRQ15256 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PTPRRQ15256 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PTPRRQ15256 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PTPRRQ15256 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PTPRRQ15256 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PTPRRQ15256 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PTPRRQ15256 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PTPRRQ15256 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PTPRRQ15256 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
PTPRRQ15256 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PTPRRQ15256 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PTPRRQ15256 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PTPRRQ15256 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PTPRRQ15256 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PTPRRQ15256 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
PTPRRQ15256 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PTPRRQ15256 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PTPRRQ15256 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PTPRRQ15256 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PTPRRQ15256 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PTPRRQ15256 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PTPRRQ15256 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PTPRRQ15256 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.6 ms