Protein–RNA interactions for Protein: Q14691

GINS1, DNA replication complex GINS protein PSF1, humanhuman

Predictions only

Length 196 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GINS1Q14691 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GINS1Q14691 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GINS1Q14691 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GINS1Q14691 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GINS1Q14691 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
GINS1Q14691 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GINS1Q14691 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GINS1Q14691 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GINS1Q14691 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GINS1Q14691 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GINS1Q14691 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GINS1Q14691 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
GINS1Q14691 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GINS1Q14691 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GINS1Q14691 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GINS1Q14691 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GINS1Q14691 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GINS1Q14691 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GINS1Q14691 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GINS1Q14691 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GINS1Q14691 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GINS1Q14691 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GINS1Q14691 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GINS1Q14691 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GINS1Q14691 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GINS1Q14691 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GINS1Q14691 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GINS1Q14691 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GINS1Q14691 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GINS1Q14691 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GINS1Q14691 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GINS1Q14691 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GINS1Q14691 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GINS1Q14691 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GINS1Q14691 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GINS1Q14691 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GINS1Q14691 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GINS1Q14691 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GINS1Q14691 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GINS1Q14691 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GINS1Q14691 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GINS1Q14691 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GINS1Q14691 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GINS1Q14691 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GINS1Q14691 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GINS1Q14691 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GINS1Q14691 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GINS1Q14691 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GINS1Q14691 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GINS1Q14691 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GINS1Q14691 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GINS1Q14691 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GINS1Q14691 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GINS1Q14691 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GINS1Q14691 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GINS1Q14691 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
GINS1Q14691 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
GINS1Q14691 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GINS1Q14691 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GINS1Q14691 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GINS1Q14691 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GINS1Q14691 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GINS1Q14691 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GINS1Q14691 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
GINS1Q14691 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GINS1Q14691 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GINS1Q14691 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GINS1Q14691 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
GINS1Q14691 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
GINS1Q14691 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
GINS1Q14691 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
GINS1Q14691 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
GINS1Q14691 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
GINS1Q14691 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
GINS1Q14691 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
GINS1Q14691 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
GINS1Q14691 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
GINS1Q14691 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
GINS1Q14691 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
GINS1Q14691 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
GINS1Q14691 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
GINS1Q14691 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
GINS1Q14691 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
GINS1Q14691 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
GINS1Q14691 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
GINS1Q14691 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
GINS1Q14691 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
GINS1Q14691 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
GINS1Q14691 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
GINS1Q14691 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
GINS1Q14691 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
GINS1Q14691 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
GINS1Q14691 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
GINS1Q14691 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
GINS1Q14691 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
GINS1Q14691 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
GINS1Q14691 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
GINS1Q14691 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
GINS1Q14691 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
GINS1Q14691 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms