Protein–RNA interactions for Protein: Q14541

HNF4G, Hepatocyte nuclear factor 4-gamma, humanhuman

Predictions only

Length 408 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HNF4GQ14541 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HNF4GQ14541 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HNF4GQ14541 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HNF4GQ14541 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HNF4GQ14541 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HNF4GQ14541 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HNF4GQ14541 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HNF4GQ14541 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HNF4GQ14541 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HNF4GQ14541 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HNF4GQ14541 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HNF4GQ14541 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HNF4GQ14541 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HNF4GQ14541 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HNF4GQ14541 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HNF4GQ14541 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HNF4GQ14541 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HNF4GQ14541 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
HNF4GQ14541 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HNF4GQ14541 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HNF4GQ14541 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HNF4GQ14541 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
HNF4GQ14541 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
HNF4GQ14541 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HNF4GQ14541 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HNF4GQ14541 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HNF4GQ14541 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HNF4GQ14541 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HNF4GQ14541 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HNF4GQ14541 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HNF4GQ14541 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HNF4GQ14541 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HNF4GQ14541 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HNF4GQ14541 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HNF4GQ14541 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HNF4GQ14541 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HNF4GQ14541 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HNF4GQ14541 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HNF4GQ14541 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HNF4GQ14541 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HNF4GQ14541 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HNF4GQ14541 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HNF4GQ14541 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HNF4GQ14541 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HNF4GQ14541 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HNF4GQ14541 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HNF4GQ14541 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HNF4GQ14541 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HNF4GQ14541 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HNF4GQ14541 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HNF4GQ14541 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HNF4GQ14541 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HNF4GQ14541 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HNF4GQ14541 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HNF4GQ14541 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HNF4GQ14541 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HNF4GQ14541 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HNF4GQ14541 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HNF4GQ14541 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HNF4GQ14541 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HNF4GQ14541 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HNF4GQ14541 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HNF4GQ14541 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HNF4GQ14541 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HNF4GQ14541 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HNF4GQ14541 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HNF4GQ14541 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HNF4GQ14541 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HNF4GQ14541 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HNF4GQ14541 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HNF4GQ14541 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HNF4GQ14541 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HNF4GQ14541 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
HNF4GQ14541 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HNF4GQ14541 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HNF4GQ14541 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HNF4GQ14541 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
HNF4GQ14541 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
HNF4GQ14541 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HNF4GQ14541 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
HNF4GQ14541 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
HNF4GQ14541 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HNF4GQ14541 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HNF4GQ14541 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HNF4GQ14541 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
HNF4GQ14541 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HNF4GQ14541 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HNF4GQ14541 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HNF4GQ14541 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HNF4GQ14541 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HNF4GQ14541 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HNF4GQ14541 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HNF4GQ14541 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HNF4GQ14541 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HNF4GQ14541 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HNF4GQ14541 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HNF4GQ14541 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
HNF4GQ14541 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HNF4GQ14541 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HNF4GQ14541 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46 ms