Protein–RNA interactions for Protein: Q14159

SPIDR, DNA repair-scaffolding protein, humanhuman

Predictions only

Length 915 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPIDRQ14159 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SPIDRQ14159 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SPIDRQ14159 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SPIDRQ14159 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SPIDRQ14159 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SPIDRQ14159 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SPIDRQ14159 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SPIDRQ14159 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
SPIDRQ14159 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SPIDRQ14159 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SPIDRQ14159 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SPIDRQ14159 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SPIDRQ14159 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SPIDRQ14159 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SPIDRQ14159 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SPIDRQ14159 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SPIDRQ14159 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SPIDRQ14159 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SPIDRQ14159 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SPIDRQ14159 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SPIDRQ14159 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SPIDRQ14159 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SPIDRQ14159 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SPIDRQ14159 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SPIDRQ14159 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SPIDRQ14159 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SPIDRQ14159 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SPIDRQ14159 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SPIDRQ14159 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SPIDRQ14159 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
SPIDRQ14159 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SPIDRQ14159 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SPIDRQ14159 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SPIDRQ14159 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SPIDRQ14159 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SPIDRQ14159 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SPIDRQ14159 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SPIDRQ14159 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
SPIDRQ14159 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SPIDRQ14159 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SPIDRQ14159 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SPIDRQ14159 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SPIDRQ14159 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SPIDRQ14159 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SPIDRQ14159 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SPIDRQ14159 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SPIDRQ14159 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SPIDRQ14159 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SPIDRQ14159 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SPIDRQ14159 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SPIDRQ14159 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SPIDRQ14159 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SPIDRQ14159 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SPIDRQ14159 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SPIDRQ14159 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SPIDRQ14159 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SPIDRQ14159 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SPIDRQ14159 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SPIDRQ14159 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SPIDRQ14159 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SPIDRQ14159 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
SPIDRQ14159 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
SPIDRQ14159 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SPIDRQ14159 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SPIDRQ14159 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SPIDRQ14159 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SPIDRQ14159 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SPIDRQ14159 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SPIDRQ14159 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SPIDRQ14159 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SPIDRQ14159 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SPIDRQ14159 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SPIDRQ14159 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SPIDRQ14159 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SPIDRQ14159 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SPIDRQ14159 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SPIDRQ14159 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SPIDRQ14159 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
SPIDRQ14159 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SPIDRQ14159 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SPIDRQ14159 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SPIDRQ14159 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SPIDRQ14159 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SPIDRQ14159 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SPIDRQ14159 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SPIDRQ14159 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SPIDRQ14159 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SPIDRQ14159 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SPIDRQ14159 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SPIDRQ14159 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SPIDRQ14159 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SPIDRQ14159 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SPIDRQ14159 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
SPIDRQ14159 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SPIDRQ14159 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SPIDRQ14159 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SPIDRQ14159 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SPIDRQ14159 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SPIDRQ14159 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SPIDRQ14159 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.4 ms