Protein–RNA interactions for Protein: Q13683

ITGA7, Integrin alpha-7, humanhuman

Predictions only

Length 1,181 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA7Q13683 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ITGA7Q13683 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
ITGA7Q13683 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ITGA7Q13683 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ITGA7Q13683 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
ITGA7Q13683 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
ITGA7Q13683 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
ITGA7Q13683 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC20.57■□□□□ 0.88
ITGA7Q13683 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
ITGA7Q13683 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
ITGA7Q13683 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
ITGA7Q13683 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
ITGA7Q13683 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ITGA7Q13683 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
ITGA7Q13683 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
ITGA7Q13683 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ITGA7Q13683 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ITGA7Q13683 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ITGA7Q13683 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ITGA7Q13683 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
ITGA7Q13683 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
ITGA7Q13683 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ITGA7Q13683 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
ITGA7Q13683 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ITGA7Q13683 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
ITGA7Q13683 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ITGA7Q13683 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
ITGA7Q13683 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ITGA7Q13683 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC20.56■□□□□ 0.88
ITGA7Q13683 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ITGA7Q13683 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
ITGA7Q13683 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
ITGA7Q13683 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
ITGA7Q13683 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ITGA7Q13683 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
ITGA7Q13683 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
ITGA7Q13683 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
ITGA7Q13683 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ITGA7Q13683 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
ITGA7Q13683 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ITGA7Q13683 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ITGA7Q13683 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
ITGA7Q13683 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ITGA7Q13683 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ITGA7Q13683 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ITGA7Q13683 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ITGA7Q13683 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
ITGA7Q13683 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ITGA7Q13683 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ITGA7Q13683 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ITGA7Q13683 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ITGA7Q13683 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ITGA7Q13683 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ITGA7Q13683 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
ITGA7Q13683 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
ITGA7Q13683 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
ITGA7Q13683 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
ITGA7Q13683 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
ITGA7Q13683 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ITGA7Q13683 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
ITGA7Q13683 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ITGA7Q13683 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ITGA7Q13683 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ITGA7Q13683 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ITGA7Q13683 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ITGA7Q13683 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ITGA7Q13683 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ITGA7Q13683 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ITGA7Q13683 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ITGA7Q13683 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ITGA7Q13683 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ITGA7Q13683 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
ITGA7Q13683 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
ITGA7Q13683 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
ITGA7Q13683 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
ITGA7Q13683 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
ITGA7Q13683 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
ITGA7Q13683 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
ITGA7Q13683 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
ITGA7Q13683 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
ITGA7Q13683 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ITGA7Q13683 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
ITGA7Q13683 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ITGA7Q13683 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
ITGA7Q13683 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ITGA7Q13683 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ITGA7Q13683 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ITGA7Q13683 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
ITGA7Q13683 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ITGA7Q13683 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
ITGA7Q13683 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ITGA7Q13683 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ITGA7Q13683 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ITGA7Q13683 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
ITGA7Q13683 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ITGA7Q13683 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ITGA7Q13683 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
ITGA7Q13683 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
ITGA7Q13683 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
ITGA7Q13683 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
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