Protein–RNA interactions for Protein: Q13564

NAE1, NEDD8-activating enzyme E1 regulatory subunit, humanhuman

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Length 534 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NAE1Q13564 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
NAE1Q13564 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
NAE1Q13564 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NAE1Q13564 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
NAE1Q13564 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
NAE1Q13564 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
NAE1Q13564 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NAE1Q13564 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
NAE1Q13564 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
NAE1Q13564 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
NAE1Q13564 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NAE1Q13564 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
NAE1Q13564 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
NAE1Q13564 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NAE1Q13564 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NAE1Q13564 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
NAE1Q13564 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
NAE1Q13564 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
NAE1Q13564 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NAE1Q13564 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NAE1Q13564 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
NAE1Q13564 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
NAE1Q13564 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NAE1Q13564 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NAE1Q13564 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
NAE1Q13564 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
NAE1Q13564 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
NAE1Q13564 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NAE1Q13564 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NAE1Q13564 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
NAE1Q13564 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NAE1Q13564 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
NAE1Q13564 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NAE1Q13564 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
NAE1Q13564 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NAE1Q13564 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
NAE1Q13564 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NAE1Q13564 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NAE1Q13564 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NAE1Q13564 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NAE1Q13564 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NAE1Q13564 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NAE1Q13564 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
NAE1Q13564 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
NAE1Q13564 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NAE1Q13564 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NAE1Q13564 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
NAE1Q13564 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NAE1Q13564 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
NAE1Q13564 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
NAE1Q13564 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
NAE1Q13564 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NAE1Q13564 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NAE1Q13564 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NAE1Q13564 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
NAE1Q13564 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NAE1Q13564 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NAE1Q13564 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NAE1Q13564 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NAE1Q13564 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NAE1Q13564 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
NAE1Q13564 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
NAE1Q13564 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
NAE1Q13564 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
NAE1Q13564 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NAE1Q13564 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
NAE1Q13564 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
NAE1Q13564 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
NAE1Q13564 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
NAE1Q13564 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NAE1Q13564 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NAE1Q13564 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NAE1Q13564 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NAE1Q13564 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
NAE1Q13564 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NAE1Q13564 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NAE1Q13564 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NAE1Q13564 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NAE1Q13564 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
NAE1Q13564 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NAE1Q13564 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NAE1Q13564 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
NAE1Q13564 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
NAE1Q13564 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
NAE1Q13564 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NAE1Q13564 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NAE1Q13564 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
NAE1Q13564 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
NAE1Q13564 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
NAE1Q13564 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NAE1Q13564 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
NAE1Q13564 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NAE1Q13564 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NAE1Q13564 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NAE1Q13564 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
NAE1Q13564 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
NAE1Q13564 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NAE1Q13564 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NAE1Q13564 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
NAE1Q13564 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
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