Protein–RNA interactions for Protein: Q13472

TOP3A, DNA topoisomerase 3-alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,001 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP3AQ13472 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TOP3AQ13472 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TOP3AQ13472 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TOP3AQ13472 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TOP3AQ13472 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TOP3AQ13472 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TOP3AQ13472 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
TOP3AQ13472 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TOP3AQ13472 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TOP3AQ13472 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TOP3AQ13472 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TOP3AQ13472 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TOP3AQ13472 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TOP3AQ13472 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TOP3AQ13472 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TOP3AQ13472 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TOP3AQ13472 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TOP3AQ13472 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TOP3AQ13472 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
TOP3AQ13472 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TOP3AQ13472 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TOP3AQ13472 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TOP3AQ13472 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TOP3AQ13472 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TOP3AQ13472 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TOP3AQ13472 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TOP3AQ13472 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TOP3AQ13472 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TOP3AQ13472 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TOP3AQ13472 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TOP3AQ13472 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TOP3AQ13472 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TOP3AQ13472 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TOP3AQ13472 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TOP3AQ13472 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TOP3AQ13472 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TOP3AQ13472 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TOP3AQ13472 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TOP3AQ13472 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
TOP3AQ13472 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TOP3AQ13472 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TOP3AQ13472 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TOP3AQ13472 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TOP3AQ13472 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TOP3AQ13472 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TOP3AQ13472 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TOP3AQ13472 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TOP3AQ13472 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TOP3AQ13472 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TOP3AQ13472 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TOP3AQ13472 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TOP3AQ13472 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TOP3AQ13472 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TOP3AQ13472 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TOP3AQ13472 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TOP3AQ13472 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TOP3AQ13472 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TOP3AQ13472 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TOP3AQ13472 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TOP3AQ13472 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TOP3AQ13472 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TOP3AQ13472 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TOP3AQ13472 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TOP3AQ13472 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
TOP3AQ13472 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TOP3AQ13472 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TOP3AQ13472 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TOP3AQ13472 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TOP3AQ13472 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TOP3AQ13472 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TOP3AQ13472 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TOP3AQ13472 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TOP3AQ13472 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TOP3AQ13472 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TOP3AQ13472 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
TOP3AQ13472 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TOP3AQ13472 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TOP3AQ13472 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
TOP3AQ13472 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TOP3AQ13472 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TOP3AQ13472 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TOP3AQ13472 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TOP3AQ13472 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TOP3AQ13472 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TOP3AQ13472 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TOP3AQ13472 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TOP3AQ13472 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TOP3AQ13472 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TOP3AQ13472 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TOP3AQ13472 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TOP3AQ13472 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TOP3AQ13472 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TOP3AQ13472 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TOP3AQ13472 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TOP3AQ13472 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TOP3AQ13472 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TOP3AQ13472 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TOP3AQ13472 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TOP3AQ13472 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TOP3AQ13472 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
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