Protein–RNA interactions for Protein: Q13326

SGCG, Gamma-sarcoglycan, humanhuman

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Length 291 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCGQ13326 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SGCGQ13326 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SGCGQ13326 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SGCGQ13326 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SGCGQ13326 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SGCGQ13326 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SGCGQ13326 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SGCGQ13326 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SGCGQ13326 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SGCGQ13326 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SGCGQ13326 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SGCGQ13326 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SGCGQ13326 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SGCGQ13326 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SGCGQ13326 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SGCGQ13326 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SGCGQ13326 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SGCGQ13326 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SGCGQ13326 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
SGCGQ13326 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SGCGQ13326 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SGCGQ13326 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SGCGQ13326 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SGCGQ13326 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SGCGQ13326 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SGCGQ13326 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SGCGQ13326 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SGCGQ13326 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
SGCGQ13326 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
SGCGQ13326 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
SGCGQ13326 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
SGCGQ13326 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
SGCGQ13326 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC18.52■□□□□ 0.55
SGCGQ13326 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
SGCGQ13326 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SGCGQ13326 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SGCGQ13326 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SGCGQ13326 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SGCGQ13326 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SGCGQ13326 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SGCGQ13326 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SGCGQ13326 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SGCGQ13326 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SGCGQ13326 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SGCGQ13326 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SGCGQ13326 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SGCGQ13326 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SGCGQ13326 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SGCGQ13326 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
SGCGQ13326 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
SGCGQ13326 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SGCGQ13326 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SGCGQ13326 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SGCGQ13326 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SGCGQ13326 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SGCGQ13326 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SGCGQ13326 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SGCGQ13326 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SGCGQ13326 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SGCGQ13326 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SGCGQ13326 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SGCGQ13326 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SGCGQ13326 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SGCGQ13326 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SGCGQ13326 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SGCGQ13326 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SGCGQ13326 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SGCGQ13326 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SGCGQ13326 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
SGCGQ13326 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SGCGQ13326 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SGCGQ13326 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
SGCGQ13326 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SGCGQ13326 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SGCGQ13326 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
SGCGQ13326 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SGCGQ13326 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SGCGQ13326 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SGCGQ13326 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SGCGQ13326 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SGCGQ13326 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SGCGQ13326 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SGCGQ13326 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SGCGQ13326 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SGCGQ13326 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SGCGQ13326 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SGCGQ13326 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SGCGQ13326 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SGCGQ13326 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SGCGQ13326 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SGCGQ13326 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
SGCGQ13326 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SGCGQ13326 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SGCGQ13326 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SGCGQ13326 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SGCGQ13326 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SGCGQ13326 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SGCGQ13326 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SGCGQ13326 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SGCGQ13326 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
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