Protein–RNA interactions for Protein: Q13216

ERCC8, DNA excision repair protein ERCC-8, humanhuman

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Length 396 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERCC8Q13216 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
ERCC8Q13216 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
ERCC8Q13216 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
ERCC8Q13216 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
ERCC8Q13216 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
ERCC8Q13216 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
ERCC8Q13216 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
ERCC8Q13216 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
ERCC8Q13216 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
ERCC8Q13216 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
ERCC8Q13216 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
ERCC8Q13216 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
ERCC8Q13216 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
ERCC8Q13216 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
ERCC8Q13216 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
ERCC8Q13216 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
ERCC8Q13216 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
ERCC8Q13216 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
ERCC8Q13216 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
ERCC8Q13216 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.1□□□□□ -0.15
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ERCC8Q13216 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC14.1□□□□□ -0.15
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ERCC8Q13216 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
ERCC8Q13216 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
ERCC8Q13216 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC14.1□□□□□ -0.15
ERCC8Q13216 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
ERCC8Q13216 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
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ERCC8Q13216 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
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ERCC8Q13216 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
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ERCC8Q13216 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
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ERCC8Q13216 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
ERCC8Q13216 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
ERCC8Q13216 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC14.08□□□□□ -0.16
ERCC8Q13216 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
ERCC8Q13216 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
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